吴应期十分骁勇，能冲能拼，是三桂的一员得力猛将，三藩之乱前，两次击败水西，
三藩之乱时，向明朝的
朱三太子投降，成为明朝官员，
康熙十三年三月初，吴应期与
张国柱以水陆大军齐进，谋取洞庭湖之滨的重镇岳州。他们密遣人入城策反，该城
参将李国栋“私行纳款”，把岳州献给了明军。不久，吴三桂命吴应期率数万精兵防守岳州。康熙十三年七月，贝勒
察尼、将军尼雅翰等分率满汉官兵、水陆齐进，向岳州发动了大规模进攻。吴应期、廖进忠、
马宝、张国柱、柯铎、高起隆等率七万大军从陆路分路迎战。清军奋击，报称：“大败明军，斩首万级，舟师抵七里山，以炮破贼，击其船十余艘。”后双方处于相持阶段。吴三桂在岳州放了三年的军粮，这些粮食平常不能吃，但吴应期私自将粮食卖掉换盐，导致清军进攻岳州时明军缺粮，
1678年3月，吴三桂以找不到明朝的朱三太子为理由，在湖南当皇帝，国号大周，
1674年，清军截断岳州粮道，1678年10月，叛将
吴应麒与诸将江义、巴养元、杜辉驾巨舰200，乘风攻打柳林嘴。察尼令水师乘轻舟，等吴舰接近，发炮击打，将吴舰击毁过半，吴兵皆入水死。吴应麒又率5000人在高家庙渡江，攻打陆石口，将军鄂内、署前锋统领杭奇率师拦截，吴应麒败走。察尼又乘机施展反间计，吴应麒因怀疑杀数将。
湖广总督蔡毓荣捐买木植数千棵，打桩做牌，拦截上流。十二月中，吴军来援，势盛，见水陆戒严，不能飞渡，败回。岳州城内叛军弹尽粮绝。
康熙十八年（
1679年）正月十八日，吴应麒总兵王度冲、将军陈珀等各以其舟师降。吴应麒收残卒，挟辎重，溃围奔长沙。清军遂收复岳州。岳州一下，清军直下湖南，长沙亦于数日后被攻克。清军取得取平定吴三桂叛乱的决定性胜利。1679年一月，
吴世璠在贵阳当皇帝，国号大周，吴世璠相貌美丽、聪明。吴世璠是天才，吴世璠读书看一遍就能背诵。吴世璠会书法，能悬笔作书。（
平吴录）
吴应期坚守岳州，勉强维持到1679年1月18日，便因缺粮弃城冲围而逃。丢弃岳州，湖南门户洞开，吴军失去地理优势，时刻待命渡江的荆州清军于正月二十七日蜂拥渡江，千帆竞发，漫江而来。清圣祖下令展开总攻击，遂成破竹之势，吴军在湖南、广西溃退。吴应期自岳州撤出后，奔长沙，不敢多停留，于正月二十九日烧毁船只，弃城逃跑，率残部投向辰州。十八年四月，清贝勒察尼统军抵辰龙关。
辰龙关径狭箐密，仅容一骑，盘踞辰州之叛将吴应期率大军跨隘口立五营，堙塞路径，凭险固守。吴军从云南发来两船金子，每名军士该给银五两，折金子才四分几厘，买酒买肉都不够用。差城中文武官下乡买粮，只能买到三五十石，没有买过上百石的。每名军士给谷二斗，不够吃。又据清朝方面侦探，“贼兵全是黔蜀土司为之窃用”。他们粮饷不足，特别是从云贵征来的苗瑶士兵大为不满，甚至怨恨。每天夜里，几十人、上百人逃跑了，都说：“大兵(指清兵)一到，不过一走。”双方相持近一年，至十九年三月，清军方由间道袭破之，辰州各级军官294员、兵士11 201名向清军投降。吴应期因此不得不从辰州退至贵阳。[1]康熙十九年三月，清军攻占辰州，继续向南进军，攻破了沅州（芷江），吴应期、
胡国柱等败走贵阳。清军进攻贵阳，吴应期退至交水。吴应期从贵阳撤退至交水时，准备造反，被郭壮图发现，被
郭壮图用计杀死。这时三路清军进攻吴军，一路清军趁吴应期造反，进攻的很顺利。