马科，西宁人，明崇祯时期将领，以偏裨平流寇积功至总兵。以敢战著称，仅次于曹变蛟。北京失陷后降于李自成，大顺军失败后又投降清朝。

人物生平

崇祯初即从李卑平流寇。

五年（1632）春，混天猴陷宜君、鄜州，其夏攻合水。马科以参将追寇至甘泉山。七月破之延水关，斩首六百二余级。其地东限黄河，贼溺死者无算，科部卒斩混天猴以献朝廷。

李卑于七年（1634）春六月卒于官，科遂改隶属洪承畴麾下。李自成欲入四川，科与曹变蛟败之，并穷追之至潼关，参与潼关南原之战，大破之，李自成以十八骑逃亡。旋任山海关总兵，从洪承畴援锦州，科驻防塔山，清将济尔哈朗率兵至城下列红衣大炮攻之，明军杀死佐领崔应泰，参领迈色，城坏二十馀丈，清军悉登，遂克塔山。《明史》：“承畴主持重,而朝议以兵多饷艰,职方郎张若麒趣战。承畴念祖大寿被围久,乃议急救锦州。七月二十八日,诸军次松山,营西北冈。数战,围不解。八月,国柱战殁,以山西总兵李辅明代之。承畴命变蛟营松山之北,乳峰山之西,两山间列七营,环以长壕。俄闻我太宗文皇帝亲临督阵,诸将大惧。及出战,连败,饷道又绝。朴先夜遁。通、科、三桂、广恩、辅明相继走。自杏山迤南沿海,东至塔山,为大清兵邀击,溺海死者无算。”王朴、唐通、马科、吴三桂、白广恩、李辅明等相继逃出重围。其后科与王朴等从海路溃归，法司准备定罪，御史郝晋认为：六镇同罪，皆宜死，吴三桂实辽左主将，不战而逃，奈何反加提督？兵部尚书陈新甲覆议：请斩王朴，勒令马科立下军令状，再失战机立斩不赦。

十五年（1642）清军取得松锦之战的胜利后再次入塞杀戮劫掠，科领兵拒敌被击败。

十六年（1643）领兵入卫北京，帝赐宴武英殿，命从大学生吴甡南征，后来没有实行。

十七年（1644）三月科跟从李建泰西征李自成，无功。

北京失陷后投降了李自成，被封为怀仁伯。不久与投降的辽东巡抚黎玉田领兵一万远征四川的明朝势力。

五月，科由汉中入川攻陷保宁，明朝川北副史项国瓒牺牲。攻陷潼川，科说降知州陈君宠，君宠不屈，与两个儿子从容自尽死。

此时张献忠已经在成都称帝所以不能容忍大顺军的势力在四川，所以他亲自领兵击败了马科，迫使大顺军退回了汉中。

弘光元年（1645）正月，科与贺珍领兵至褒城，攻大西军于广元，大西军屠广元而走。张献忠命令刘进孝屠杀保宁，贺珍的部将严自明、郑天禄大肆劫掠保宁而回。

正月十二日，清军占领了潼关清军击败李自成进入西安，科与贺珍、白广恩等人投降。

七月贺珍反正归明，十月进攻马科于汉中，科击退了贺珍并杀死了他的部将魏景龙。

后事不详。