2006年世界杯亚洲区预选赛决定出4个直接出线2006年世界杯的席位及一个附加赛席位。参加球队必须是亚足联成员国，在44个成员国当中共有39队参加预选赛，5队没有参赛的球队包括菲律宾、文莱、柬埔寨、不丹以及缅甸（缅甸被除名）。

亚洲区预选赛是共分三轮作赛：第一轮出线的7支队伍可晋级第二轮；第二轮以小组形式进行，小组首名的8支队伍可晋级第三轮；第三轮同样以小组形式进行将8队各分两组，小组首名及次名的4支队伍可晋级世界杯决赛周，而两组第三名需进行附加赛，胜方的队伍与中北美洲及加勒比地区的小组第4名再进行附加赛， 胜方的队伍才可以得到一个出线决赛周席位。

第一轮是根据2003年10月22日前国际足联世界排名最低的14支亚洲区国家或地区参加并进行抽签，分成2队进行双循环淘汰赛，7队的胜方球队将会晋级第二轮。

赛果

以下是第一轮落败者的积分榜，按每队于第一轮成绩排列，老挝成为最佳成绩球队可晋级第二轮

预选赛第二轮将32队共分为八组，而曾参与2002年世界杯的四支球队，包括韩国、中国、沙特阿拉伯和日本分开，并不会同组。每队互相对赛，采取主客双循环赛制，胜出得3 分，和得1分，负则0分。按各队于分组赛的总得分排列，每组的首名可进入第三轮阶段。

第一组

第二组

第三组

第四组

第五组

第六组

第七组

第八组

晋级球队

八支球队晋级后分为两组，每组4支球队，进行双循环的对赛。6场对赛结束以后，两组的首两名球队直接晋身2006年世界杯决赛周，而两组的第三名需进行附加赛。

A组

B组

两组的第三名分别先会进行双循环的对赛，两场合算胜方出线，将与中北美及加勒比地区的第四名进行附加赛。