2020年3月初，在博茨瓦纳北部的奥卡万戈三角洲，出现大象因不明原因死亡事件，之后大象的死亡数量一路攀升，近两个月内已有超过350头大象死亡。死亡的大象既有公象也有母象，包括各个年龄段，它们大部分死在水源地附近，或者突然倒地死去，或者原地步履蹒跚地转圈后慢慢死去。一些观察人士称，未来还将有更多大象死亡，“这是一场大象保护的灾难”。
2020年7月2日，博茨瓦纳政府发表声明说，政府在调查西北部地区275头大象离奇死亡的原因，没有发现偷猎的证据。已经确定由津巴布韦、南非和加拿大的3个实验室处理从大象尸体上收集的样本。
2020年8月7日，博茨瓦纳环境、自然资源保护和旅游部表示，通常引发野生动物中毒的九种农药和化学药品的毒理学分析报告显示，样本检测均呈阴性。另外，他们还排除了由于两种可疑的
矿物元素和饥饿引发大象死亡的情况。声明说，迄今为止获得的结果并不能排除中毒可能。因此，仍在研究包括自然产生的毒素在内的环境因素。
2020年8月，一个国际专家团队在《非洲野生动物研究杂志》上发表评论文章认为，基本可排除人为投毒、偷猎、饥饿、炭疽感染致死的可能。专家团队呼吁进行全面、快速的流行病学调查，以掌握当地疾病传播动态，同时开展深入的实验室研究。他们指出，如果不找到造成这些大象死亡的真正原因，就很难防止类似情况再次发生。
2020年9月21日，博茨瓦纳野生动物和
国家公园管理局宣布，2020年3月以来在该国西北部发生的数百头大象死亡事件由水中有毒的蓝藻细菌引发。博茨瓦纳野生动物和国家公园管理局首席兽医官吕本·姆马迪当天在记者会上说，在送往实验室的样品中检测出了蓝藻毒素，由此得出结论，蓝藻
神经毒素是导致大象死亡的原因。他表示，目前仍有许多问题存疑，比如为什么只有大象会死亡。
2024年12月，一项由伦敦国王学院领导的研究对此提供了进一步的证据，表明2020年博茨瓦纳300多头非洲大象的死亡是由于饮用了由于气候变化导致有毒藻类数量激增的水坑中的水而导致的。
博茨瓦纳政府尚未对死亡大象尸体进行样本检测，因此遭到外界批评。一些生物专家称，考虑到病毒传播可能，这一诡异现象或存在威胁人类健康的风险，不尽快确定大象死因可能会造成严重后果。
环境保护主义者则敦促当地政府派人看守死去大象的象牙。