Apurinic/apyrimidinic (AP) endonuclease (BRENDA = 4.2.99.18) APE参与
碱基切除修复。在核苷酸损伤及错配的修复方面的主要用是在DNA葡萄糖转移酶将损坏的碱基移除时构建的磷酸骨架上制造缺口。根据其制造缺口的位点，可分为四类。 一型和二型在DNA磷酸基团3′和 5′间制造碱基缺失位点并遗留3′-OH 和 5′-磷酸末端。三型和四型切割位置相同,但是造成 3′-磷酸和 5′-OH。 人APE(APE1)同大多数 APE一样，属于二型并需要二价镁离子于其活性位点以完成在
碱基切除修复中的功能。