DNA印迹杂交，是指进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。1975年由英国人萨瑟恩创建。一般利用
琼脂糖凝胶电泳分离经
限制性内切酶消化的DNA片段，将胶上的
DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上，经干烤或者紫外线照射固定，再与相对应结构的标记探针进行杂交，用
放射自显影或酶反应显色，从而检测特定
DNA分子的含量。DNA印迹杂交技术是分子生物学领域中最常用的方法之一。
其基本原理是，具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下，可按碱基互补的原则形成双链，此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方法的灵敏性，综合凝胶电泳和核酸内切限制酶分析的结果，便可绘制出
DNA分子的限制图谱。