java开源项目，就是基于java语言的开源项目。Java：是企业级应用开发的首选语言。IBM为跟Sun争Java的主导权，同时跟 Oracle和微软争企业应用的市场份额，于是IBM成为推动 Java基础项目的开源开发方面最用心和最用力的企业。IBM对Apache Jakarta项目的大力扶持，使得Java有了强劲的Tomcat服务器，有了Apache Commons一系列基础开发组件；IBM的Eclipse的扶持，则让Java有了强劲的开发环境。
跟PHP不同的是，Java的开源更多集中在功能模块上的开发，而面向最终用户方面的开源应用系统则明显不如PHP那么多，从功能上看，也不如PHP开发应用那么成熟，这主要原因是Java程序对服务器要求较高，共享
主机时，功能有限的PHP在安全、管理方面也更加灵活、可控。
支持e-Science的协同工作环境（Duckling）是中国科学院计算机网络信息中心
协同工作环境研究中心专为科研团队提供的综合性资源共享和协作平台。面向新型科研活动方式的需求，通过
协同工作环境核心工具集和学科应用插件，集成网络环境中的硬件、软件、数据、信息等各类资源，为科研人员提供先进的信息化科研平台。
虚拟组织管理工具（UMT）是一种面向虚拟组织的用户管理系统，提供虚拟组织从创建、运行到撤销整个生命周期的各项管理功能，支持用户资料的应用定制，解决了在多个虚拟实验室应用之间的
单点登录问题，有利于科研人员与合作伙伴进行联系和交流，为整个虚拟实验室的应用提供了一个统一的用户管理解决方案。
文档协同工具（DCT）是一种支持虚拟组织的协作式写作和
文档共享工具。虚拟组织成员使用所见即所得的
编辑器可以便捷、高效地协同开发、组织管理和共享各类数字化文档。该工具实现了易于管理的内容发布和快速建立信息门户的功能，可在项目申请、项目执行等各个环节的大量
文档管理工作中发挥重要作用。
文档库管理工具（CLB）是一个以搜索为导向的协同工作环境资源库。该工具摒弃传统的分类
文档管理方法，采用了序列化、搜索、聚类等文档定位方法，提供完善的文档
版本管理、权限管理、文档全文检索和标签检索功能，支持用户统一认证管理，从而实现更加灵活高效的管理和共享各类数字化文档。
统一通信工具（
UCT）支持虚拟组织成员之间通过Web方式发送、接收、回复和查看手机短信，实现了虚拟组织成员的短信协同办公。该工具需要硬件模块支持。
活动组织工具（AAT）该插件可协助科研人员完成各类科研活动的组织与开展，目前主要针对学术 /科技会议的组织与管理，包括会议网站的整体框架、会议相关信息的维护与管理、用户注册与用户管理、摘要提交与管理、摘要审核、摘要导出及出版、酒店预订与管理、会议信息的发布等功能。
Spring是一个解决了许多在J2EE开发中常见的问题的强大框架。Spring提供了管理
业务对象的一致方法并且鼓励了注入对接口编程而不是对类编程的良好习惯。Spring的架构基础是基于使用JavaBean属性的Inversion ofControl容器。然而，这仅仅是完整图景中的一部分：Spring在使用IoC容器作为构建完关注所有架构层的完整解决方案方面是少有的。 Spring提供了数据访问抽象，包括简单和有效率的JDBC框架，极大的改进了效率并且减少了可能的错误。Spring的数据访问架构还集成了 Hibernate和其他O/R mapping解决方案。Spring还提供了
事务管理抽象，它能够在各种底层事务管理技术，例如JTA或者JDBC事务提供一个一致的编程模型。 Spring提供了一个用标准Java语言编写的AOP框架，它给POJOs提供了声明式的
事务管理和其他企业事务--如果你需要--还能实现你自己的 aspects。这个框架足够强大，使得应用程序能够抛开EJB的复杂性，同时享受着和传统EJB相关的关键服务。Spring还提供了可以和IoC容器集成的强大而灵活的MVCWeb框架。