在根冠与分生组织区交界处有一个根的组织中心（organizing centre），该处的细胞基本不发生分裂和分化，因此又称为静止中心（quiescent centre）。静止中心的形成可以作为胚根起始的标志。

在静止中心的周侧根围是根的各类干细胞（stem cell），它们能够通过不对称分裂（asymmetrical division）不断进行自我更新并产生可以分化为不同类型根细胞的子细胞来维持根的生长。其中根冠的干细胞层与分生组织区之间由于有静止中心相隔，近年来也称为根冠分生组织（root cap meristem；Bennett和Scheres，2010）。静止中心能够产生一个小范围的信号来控制其周围干细胞的分裂与分化（van den Berg等，1995；Scheres等，2002），其覆盖的区域通常称为干细胞小生境（stem cell niche），而干细胞分裂产生的一些子细胞正是由于超出了信号控制范围才会开始分化（Scheres，2007）。