RNA印迹杂交，是指检测、定量mRNA大小及在组织中表达水平的标准方法。既是能直接提供有关RNA完整性、不同的剪接信息及mRNA大小等信息的唯一方法，也是在同一张膜上直接比较同一信息在不同样品中的表达丰度的首选方法。RNA印迹杂交由斯坦福大学的G.Stark于1975年发明。其原理是在变性条件下将待检的RNA样品进行琼脂糖凝胶电泳，继而按照与DNA印迹杂交相同的原理进行转膜和用探针进行杂交检测。命名为RNA印迹杂交是因为其原理与萨瑟恩发明的DNA印迹杂交原理相：似，实验过程也相似，所以取了一个类似的名字i叫RNA印迹杂交。

如今在做基因的表达分析时，有多种技术可供选择，包括RT-PCR、RNA：酶保护试验、微阵列、基因表达的系列分析以及RNA印迹杂交。虽然微阵列基因芯片技术被广：泛应用，但在对特定基因RNA印迹杂交的实验：结果因微小的表达量变化的测定上，RNA印迹：杂交的灵敏度还优于微阵列技术。