《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》创刊于1988年，是经中华人民共和国新闻出版总署批准，由佛山科学技术学院主管、主办的学术期刊。

1988年，《佛山农牧高等专科学校学报》创刊。

1996年，该刊刊名改为《佛山大学学报》，刊期为双月刊。

1998年，该刊刊名改为《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》，刊期改为季刊。

2007年，该刊刊期改为双月刊。

2014年12月，该刊入选中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》设有数字理论、机电自动化、土建工程、化学与化工、环境科学、信息科学、农业与生物技术等栏目。

据2019年5月《佛山科学技术学院学报》编辑部官网显示，《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》编辑委员会有编委27人，编辑部有编辑2人、编辑秘书1人。

2016年10月21至23日，《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》主编万伟成参加主题为“民间外交与文明融合”的第九届池田大作思想国际学术研讨会。

据2019年5月6日中国知网显示，《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》共出版文献2562篇。

据2019年5月6日万方数据知识服务平台显示，《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》共载文2227篇、基金论文量为831篇。

《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》是中国期刊网数据库全文收录期刊，被美国美国《化学文摘》（CA）收录。

据2019年5月6日中国知网显示，《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》总下载315403次、总被引7715次，（2018版）复合影响因子为0.234、（2018版）综合影响因子为0.143。

据2019年5月6日万方数据知识服务平台显示，《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》被引量为6283次、下载量为44740次；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，该刊影响因子为0.22，在全部统计源期刊（6735种）中排第5087名，在大学学报（自然科学）类刊（269种）中排第243名。

《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》是Caj-cd规范获奖期刊，获中国优秀期刊奖。

《佛山科学技术学院学报（自然科学版）》坚持社会主义方向，遵循“双百方针”，以学科创新性、应用性和地方性为特色。