“三峡库区植物生态与资源重点实验室”是2000年批准建设的重庆市重点实验室，主要依托西南大学进行建设。本实验以三峡库区的生态系统特别是植被生态系统的演变、结构和功能及三峡库区的生物多样性变化和保护等为研究对象，主要开展以下四个方向的研究工作：植物生态学，植物保护生物学，植物遗传育种和植物资源制药。

本实验室依托三峡库区开展研究，具有很强的研究特色和研究能力，同时由于特有的地理优势，使本实验室在三峡库区的生态环境和资源研究领域具有不可替代的地位和作用。

近五年实验室在原有基础上投入仪器设备经费450余万元。本实验室现有精密仪器设备：BUCHI全自动凯氏定氮仪、CI310光合系统、LI6400光合系统、PhytoPam浮游植物叶绿素荧光分析仪、根系分析系统、LI1400辐射计、LI2000植冠分析仪、Flow32茎流计、测量GPS等设备30多套（台），其中部分设备为国内仅有。还有超速离心机、柱层析系统、透射电子显微镜、扫描电子显微镜、色-质联用仪、气相色谱仪、高效液相色谱仪、红外分光光度计、原子吸收光度计、SM-21型微电极操纵器等大型设备作为公用平台，开放使用。本实验室仪器设备向校内外开放。随着学科的不断发展，还将通过各种渠道筹集资金，购置新的仪器设备、改善科研条件，进一步提高研究水平。

本实验室研究队伍整齐、年富力强、梯队合理、实力雄厚、成果丰硕，现有研究人员固定人员20多人，其中教授9人（其中留学回国人员3人，博士生导师5人），副教授13人；15人具有博士学位，硕士生导师17人。有重庆市生态学、植物学、生物数学学术技术带头人各1人。较强的研究力量为市级重点实验室的建立提供了可靠保障。

近五年来，实验室曾获国家自然科学奖2项，省部级科技进步奖8项，申请专利9项其中已批准2项，在国内外重要刊物上发表论文275篇，承担国家级课题14项，省部级课题45项，其他课题21项，科研项目经费达794多万元。还同中科院生态环境研究中心、中科院地理资源研究所、中科院植物研究所、荷兰乌德勒支大学、美国保护生物学研究所、德国Julich Research Center等国际国内高等院校和研究机构间保持着密切的学术交流和共同进行人才培养。重点实验室的建立搭建了一个更为广泛的平台，利用大学已有的学术影响，充分联系本地其它的高校和科研单位，进行优势互补和开展更为广泛的合作与交流，努力提高重庆本地的生态学科研水平，更好地为地方经济服务。