三沙市国家税务局组建于2013年，截至2015年5月，该局有内设机构3个，1个派出机构，有国税工作人员10人。三沙市国税系统负责征收管理的纳税户截至2015年5月有183户。
海南省国家税务局海洋石油税务分局与三沙市国家税务局
合署办公。
经
国家税务总局批准，三沙市国家税务局和海南省国家税务局海洋石油税务分局于2013年1月正式挂牌成立，两个机构合署办公。
2014年6月，该局有内设机构3个，1个派出机构，全系统有国税工作人员7人，负责征收管理的纳税户有44户。到2015年5月，该局有内设机构3个，1个派出机构，全系统有国税工作人员10人，负责征收管理的纳税户有183户。