上海中邦足球俱乐部的前身是上海群英足球俱乐部。俱乐部聘请了原
中国国家女子足球队主教练
马良行为球队主教练。2009年浦东中邦队在上海参加全国
中甲联赛，拥有一支
中超球队、两支中甲球队的上海足球盛况空前，媒体、球迷关注度大大提高。
迄今为止中国足球联赛中有过三支叫做
上海中邦的足球俱乐部，第一支是收购大连赛德隆足球俱乐部组建的上海中邦足球俱乐部，2005年底被上海九城老板朱骏收购90%股份更名
上海联城足球俱乐部联城中邦队，2007年初与
上海申花足球俱乐部合并；第二支是收购上海中欧集团上海群英足球俱乐部七斗星队组建的上海中邦足球俱乐部浦东中邦队，2011年1月28日被收购更名贵州智诚足球俱乐部；第三支是以
上海东亚足球俱乐部梯队球员为主的第十二届全运会上海男子足球队（甲组）组建的上海中邦足球俱乐部，2012年12月27日，上海东亚足球俱乐部冲超成功，为充分整合上海足球资源，经根宝和中邦协商收回整队。
卫平曾结缘五支上海球队，以中邦名义三度投资足球（另两次分别以上海浦东足球俱乐部和上海东亚足球俱乐部特莱士队名义），所以先后出现过三支名为中邦的球队，但其实都不是一支队伍。
2003年，大连赛德隆以3600万的价格转让给安平俱乐部，大连赛德隆队将更名为珠海安平队，以珠海为主场参加甲B联赛。一直负责此事操作的中邦老板卫平出任俱乐部董事长，而曾经在申花担任过领队、后来又在浦东俱乐部任常务副总的邹忠伟出任总经理，球队主教练是曾任中国女足主帅的
马良行。2004年，珠海安平更名为珠海中邦并打入中超。2005球队迁至上海，珠海中邦足球俱乐部正式更名为上海中邦足球俱乐部，将主场放在浦东源深体育中心，训练基地则位于奉贤。在马良行的带领下，上海中邦获2005年中超联赛第11名，赛季结束后，上海中邦将俱乐部90%产权转让给了上海联城俱乐部。朱骏担任俱乐部董事长，傅鹏出任俱乐部新总经理，曾在中国打拼多年的巴西人卡洛斯出任主教练。2006年，球队以“上海联城中邦队”的名字征战中超联赛。2007年，上海联城与上海申花合并后，注销中超参赛资格。
2008赛季前，中邦集团入主后俱乐部迁往邻近城市无锡，球队名称为无锡中邦城市队，为了俱乐部名和之前征战中超的上海中邦区别则更名为上海众邦足球俱乐部，中邦和众邦城市分别作为俱乐部和球队冠名使用，主教练为上海足球名帅马良行，这也是中邦集团第二次入主一支足球队。同时俱乐部的投资人卫平还是近十年前上海浦东足球俱乐部（
北京人和足球俱乐部前身）的投资人，这支中邦也因此与上海足球历史上除上海申花以外仅有的两支顶级联赛球队均有颇深的渊源。
2009年，球队将主场搬回上海，俱乐部名称也悄然变更回上海中邦足球俱乐部，并开始使用浦东中邦的队名。2010年末上海中邦足球俱乐部接手上海全运会参赛队。上海中邦足球俱乐部和上海市体育局就联合组建第十二届全运会上海男子足球队（甲组）举行了签约仪式，而上海中邦足球俱乐部也将中甲资格和全部球员于2011年1月29日转让给力中乙贵州智诚足球俱乐部。
2010年12月29日，上海市体育局和上海中邦足球俱乐部就联合组建第十二届全运会上海男子足球队（甲组）举行了签约仪式。上海市体育局党委书记、局长李毓毅、上海市体育局副局长韩秀芳、上海东亚足球俱乐部徐根宝出席了仪式。受上海市体育局委托，上海市足球运动管理中心主任隋国扬和中邦置业集团董事长、总裁卫平代表合作双方在协议上签字。
在新赛季中上海中邦与上海东亚进行资源整合之后，由一批1993和1994年龄段球员组成的“新中邦”队由于将代表上海出战2013年全运会男足比赛，2011年起该队参加中乙联赛来锻炼队伍。值得一提的是，从陕西队退下来一直赋闲在家的上海籍名帅成耀东此次正式执掌中邦队的教鞭。这支承载着为上海征战第十二届全运会任务的球队也将从明年开始，出征乙级联赛。
2012年12月27日，上海东亚足球俱乐部冲超成功，为充分整合上海足球资源，经根宝和中邦协商收回整队，无条件终止和东亚的三年合作协议，让中邦全运队无条件回归东亚。