上海交通大学工程管理研究所主要开展土木、建筑与水利工程管理方面的教学、科研和培训工作。所长由校务委员会副主任沈为平教授担任，胡昊教授任执行所长，并聘请了国内外知名的工程管理专家担任顾问。

土木工程系恢复建系以来，积极开展了建筑工程管理方面的研究和人才培养工作，承担了包括国家自然科学基金重大项目、上海市科委重大攻关项目等在内的一系列课题，发表了大量论文，培养了研究生 50 余名，在国内具有较大影响力。 2003 年，原建筑工程与力学学院批准成立工程管理研究所。

主要研究方向：建筑经济与管理、建设监理、工程项目管理、施工技术、可持续建筑评估与技术经济分析、房地产经济与管理等。同时，研究所还承担了土木工程专业工程管理方向的本科生教学工作，现有工程管理方向在读研究生 20 多名。