上海医学科技奖经上海市政府科技主管部门批准，由上海市医学会设立，旨在表彰奖励在医学领域科技进步中做出贡献的优秀个人和集体，促进上海医学科技事业的发展。

2002年12月全面启动后，得到了全市广大医学科技工作者及卫生行政部门的大力支持，上海医学科技奖在上海医药卫生行业中的权威性正在不断提高。

为了更好地推动科技成果的推广应用和转化，为了鼓励、引导广大医务工作者积极开展社区卫生方面的工作，在深化医药卫生体制改革和促进卫生事业发展方面发挥更大的作用，根据广大医学科技工作者、全市各级医疗卫生机构和有关方面的反映和要求，上海医学科技奖从第八届开始增设“上海医学科技奖（成果推广）”和“上海医学科技奖（社区卫生）”两个奖项。

2023年4月19日，2022年度上海医学科技奖项目名单公布。

2021年度上海医学科技奖一等奖答辩会暨奖励委员会委员会议于2022年9月14日在上海市医学会学术报告厅举行。本届医学科技奖通过严格的形式审查、初评、复评、终评答辩，经上海医学科技奖励委员会审定批准，最终授予一等奖项目7项，二等奖项目20项，三等奖项目36项。

2022年11月30日下午，2021年度上海医学科技奖颁奖大会在沪举行，表彰在医学领域科技进步中做出贡献的优秀项目团队。

2023年4月19日，2022年度上海医学科技奖一等奖答辩会暨第五届上海医学科技奖奖励委员会第一次全体委员会议在上海市医学会学术报告厅举行。经审议，56个科研成果为本届上海医学科技奖获奖项目，其中一等奖7项、二等奖18项、三等奖26项、成果推广奖3项、社区卫生奖2项。浦东新区卫生健康系统的多家单位作为主要完成单位获得相关奖项。