下设11个职能处室：党委办公室（组织人事处）、综合秘书处、政策法规处、计划财务处、贷款管理处、归集管理处、审计稽核处、信息管理处、技术开发处、事务受理办公室、网站管理办公室。下设11个区（县）管理部：市区、
宝山区、
嘉定区、
浦东新区、
青浦区、
闵行区、
南汇区、
松江区、
奉贤区、
金山区、
崇明县。
1 、贯彻执行有关住房公积金管理的法规、规章和政策；结合本市实际，拟订住房公积金具体管理办法和措施，经市
住房公积金管理委员会审议通过后实施。
2 、编制住房公积金的归集、使用计划，经市
住房公积金管理委员会批准后组织执行；编制住房公积金归集、使用计划执行情况的报告。
4、 编制住房公积金的预算、决算，经市财政局审核，报市
住房公积金管理委员会审议后组织执行。
5 、负责住房公积金的统一核算；负责住房公积金的保值、增值和归还，提出住房公积金增值收益分配方案，经市财政局审核，报市住房公积金管理委员会审议后执行；申请并办理住房公积金呆坏帐的核销。
6 、负责住房公积金的归集；经市住房公积金管理委员会批准，审核、办理单位降低住房公积金缴存比例或者缓缴的申请；审批住房公积金的提取和
个人住房公积金贷款的发放。