上海市农业科学院农产品质量标准与
检测技术研究所由
农业部食用菌产品质量监督检验测试中心（上海）、上海市饲料质量监督检验站和上海市农业科学院测试中心于2006年4月合并组建而成，行政隶属于上海市农业科学院。
其中，
农业部食用菌产品质量监督检验测试中心（上海）是农业部授权并经过国家计量认证的部级食用菌专业专职质检中心，也是上海市农产品质量认证中心委托检验机构；上海市饲料质量监督检验站是
上海市质量技术监督局授权的饲料质量监督检验机构、上海市饲料工业标准化委员会挂靠单位、上海市市级科技成果鉴定检测机构和上海市饲料工业职业技能鉴定站培训考核基地；上海市农业科学院检测中心是中国上海测试中心农业系统测试点。
研究所现有职工34人，其中博士2人、硕士9人，具有高级职称6人，中级职称9人。研究所下设办公室、技术部、仪器检测技术研究室、生化检测技术研究室、标准与认证研究室等部门。实验室配有
等离子发射光谱仪、氨基酸自动分析仪、
高效液相色谱仪、气相色谱-质谱分析仪、
气相色谱仪、
原子吸收分光光度计、原子荧光分光光度计、
紫外分光光度计、半自动定氮仪、自动脂肪抽提议、
纤维测定仪、微波消解仪等现代大型精密分析仪器。
研究所以
检测技术、
质量标准研究和农产品质量认证技术服务为重点研究方向，开展农业标准化和检测技术研究。研究所开展的研究工作包括：兽药和农药残留评价及快速检测技术研究、农产品安全生产配套监控技术体系的研究、新型快速检测技术的研究、
农业投入品质量检测技术研究和食用菌生理生化研究等。研究所科研人员主持或参与了多项农产品国家标准、行业标准及企业标准的制定或试验验证工作，其中主持制定有关食药用菌的国家和行业标准14个，负责和参与制定省级地方标准15项。研究所科研人员还承担了多项国家和市重点研究项目，取得科技成果50余项；发表论文160余篇；撰写著作11册；为全国各地培训检化人员1100余人，帮助农业部职业技能考核站考核饲料检验人员特有工种职业技能鉴定200多人。在有机农业、综合农业、标准化农业、无公害农业的科技贡献力、经济拉动力和分析测试辐射力方面起到了积极作用。
研究所还承担农业部或上海市政府有关部门下达的食用菌、饲料和其它农产品及制品的质量监督和检测技术服务工作,可进行98类饲料产品的卫生指标和常规指标检测、药物残留分析；开展涉及食用菌、菌种及蔬菜、水果等农产品中69个项目的检测业务；同时还可以开展其它各种农产品及其制品中有关农药残留、兽药残留、有害微生物、毒素、
化学毒物、
重金属、营养成分、品质鉴定和基因分析，以及农业投入品质量监控和检测等方面的服务，为企业和个人提供科学、准确、公正的检测数据。
研究所可以及时为政府部门提供农产品质量安全方面的数据及建议，做好政府部门的技术依托。研究所的主要部门多次承担了农业部下达的全国食用菌产品质量安全普查工作，以及各种
调研、抽查工作；还承担了上海市下达的饲料产品
监督抽查、农资产品打假、市重点产品质量
监控和专项抽查等任务。