上海市脑功能基因组学重点实验室，时间是1999年9月，作者是钱卓博士。

1999年9月，钱卓博士在《自然》杂志发表重要论文《Genetic Enhancement of Learning and Memory in Mice 》(即构建“聪明鼠”研究学习与记忆问题)，引起了学界和社会的广泛关注，也成为钱卓母校华东师范大学实施“以杰出学科带头人提升学科建设水平”治校策略 的一个重要契机。

随后，学校主管领导与钱卓博士进行了多次的沟通与商讨。在校领导策划、钱卓博士牵头、生命科学院及科技处有关人员的 配合下，通过各级政府为优秀人才设立的“绿色通道”途径，我校于2001年5月首先获准设立了“功能基因组学”上海市重点学科，紧接着于2001年10月 成立了上海市脑功能基因组学重点实验室，2002年1月成立了脑功能基因组学教育部重点实验室，2002年10月“脑功能基因组学”列为“十五”“211 工程”重点建设项目。为方便管理，学校于2002年10月将各重点项目集成后成立了华东师范大学脑功能基因组学研究所。

2002年9月，在钱卓博士的鼎力引荐下，胡应和博士全职回国，担任该所的执行所长兼重点实验室执行主任，研究所自此步入了实质性建设阶段。

在钱卓博士和胡应和博士的带领下，在学校领导大力支持和各职能部门的配合下，脑功能基因组学研究所白手起步，逐步进入了良性发展轨道。

重点实验室依托领先的基因工程技术，以脑功能模式动物的构建与分析为中心，从基因、细胞、神经元网络以及认知行为等多层次上，对学习、记忆等高级脑功能展开系统性研究，以揭示大脑认知功能的基本原理。

1. 脑基因组学与蛋白组学研究 运用先进的功能基因组学和蛋白组学技术，对基因和蛋白在整体动物大脑中的表达、活性和调控等问题展开深入研究，揭示相关基因与蛋白在大脑学习、记忆等高级认知活动中的重要作用。

2. 脑功能模式动物构建与分析 利用转基因或基因敲除技术，构建小鼠、大鼠、猴等脑功能模式动物，结合生化、生理、行为学等多种研究手段，从细胞和整体行为等不同层次，研究高级认知功能的神经机理。

3. 学习记忆神经编码 以尖端的高密度群体神经元在体记录技术为核心手段，结合脑功能模式动物，研究大脑学习、记忆过程中的群体神经元编码规律，从神经元网络水平探讨大脑学习记忆信息编码的基本原理。

4. 脑基因功能的分子调控 根据脑功能相关基因药靶的特性，围绕中草药化合物库建立筛选平台，研究小分子天然产物对相关脑功能基因表达及活性的调控作用，研发对脑疾病靶点基因起作用的药物先导化合物。

5. 感知觉信息处理及可塑性 采用神经生理学和心理物理学方法研究感觉系统对感知觉信息的处理机制；采用神经生理学、分子生物学、神经药理学方法研究感觉信息处理的可塑性；采用行为学、心理物理学、生物医学、生物工程技术和神经药理学、分子生物学等方法研究感觉功能异常与修复。

以上述五个方向的研究目标为核心，重点实验室组建了基因组学、蛋白组学、模式动物构建、模式动物分析、神经编码分析、神经药物研发等环环相扣的脑科学研究六大技术平台。并以此为依托，围绕大脑学习、记忆等高级认知功能的一些重大基本问题，展开了从“基因——神经突触——神经网络——脑功能——脑疾病药物研发”的整合性研究，承担了国家“973计划”、“863计划”等重大科研项目，获得了一批初步研究成果，论文发表在《Neuron》、《PNAS》等国际专业杂志。

由于重点实验室在认知神经科学领域的崛起，已先后有包括Thomas Sudhof、Joshua Sanes、Richard Thompson和Roger Nicoll等8名美国科学院院士以及德国马普医学研究所所长Peter Seeburg、法国巴黎高师生物系系主任Antoine Triller、英国皇家科学院院士John O’Keefe教授等国际权威科学家来实验室进行学术交流。