由近代名医朱南山筹建于1935年12月，1936年2月正式成立。该院“以研究中国历代医学技术，融化新知养成国医专门人才为目的”该院与上海其它中医院校最大区别是设立研究院。

该研究院“以实现国医科学化，养成国医高深人才以供社会需要，并以科学方式证明国医理论及治疗经过，以供世界医学者之研究为宗旨。”（RegulationsofResearchInstituteinMedicalCollegeofNewChina.BulletinofTCM,1936,3(11):39-40.新中国医学院研究院章程，国医公报，1936，3(11):39-40）。