东南大学物理学院是东南大学下设的二级学院。

1904年，三江师范学堂设立格致科，先后更名为理化科、理化数学部、数学理化部等。

1920年，南京高等师范学校时期的数学理化部与国文史地部合并为文理科，下设物理系等8个系。

1952年，全国高等学校院系调整，南京工学院设立物理教研组，物理系从此中断。

1983年，成立物理化学系。

1989年，更名为物理系。

2017年1月，成立物理学院。

据2022年7月学院官网显示，学院设有2个本科专业：物理学、应用物理学。

据2022年7月学院官网显示，物理学院有教职工114人，其中专任教师91人（教授41人，副教授42人，讲师8人），实验技术人员15人（高级工程师3人，工程师级12人），机关管理人员8人。专任教师队伍的博士学位比例达到97%，有博士生导师35人，硕士生导师84人。学院有国家杰出青年科学基金获得者人1，国家优秀青年科学基金获得者3人，国家青年人才项目入选者8人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者8人，江苏省杰出青年基金获得者1人，江苏特聘教授2人，江苏省“333高层次人才”培养工程入选者6人，江苏省“六大人才高峰”高层次人才入选者5人，江苏省“青蓝工程”培养对象入选者6人，江苏省双创团队1个，江苏省双创人才3人，江苏省双创博士8人，东南大学首席教授1人、特聘教授1人，东南大学青年首席教授4人、青年特聘教授1人。