东方次睾吸虫是后睾科、次睾属微生物。

东方次睾吸虫成虫寄生部位为肝胆管与胆囊。虫体呈叶片状，体长2.998～6.806㎜，宽0.6142～1.6434㎜。体表具小棘。口、腹吸盘之。虫卵呈卵圆形，有盖，肩峰不明显，外壳光滑，前端稍窄，后端有小结突起。成熟虫卵呈橙黄色，卵内含毛蚴。囊蚴形态呈圆形或椭圆形，囊壁较厚，结构分为两层，囊内有一卷曲幼虫，活动自如，排泄囊为棕黄色。

成虫寄生于人或哺乳动物的胆管内。