丝绸之路考古合作研究中心是考古机构，中心实施理事会领导下的中心主任和首席科学家负责制。

2018年1月，西北大学成立丝绸之路考古中心。

2020年6月成立陕西省丝绸之路考古研究中心。

2021年5月国务委员兼外长王毅在西安主持“中国+中亚五国”宣布中方计划在中国西北大学建立“丝绸之路考古合作研究中心”。

2021年7月，西北大学在整合西北大学丝绸之路考古中心和陕西省丝绸之路考古中心研究力量的基础上，成立了丝绸之路考古合作研究中心，陕西省文物局为牵头单位，西北大学为实施单位，统筹陕西省考古研究院、西安文物保护考古研究院、国际古迹遗址理事会西安国际保护中心等省内外优势资源，与丝路沿线国家共同建设。

2023年4月25日，丝绸之路考古合作研究中心揭牌。

2024年9月23日，丝绸之路考古合作研究中心喀什分中心在喀什大学揭牌，这是2023年丝绸之路考古合作研究中心在西北大学揭牌之后，在全国设立的第一个分中心。

截至2023年4月，西北大学已与哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、乌兹别克斯坦、塔吉克斯坦、俄罗斯、蒙古国、伊朗、巴基斯坦等8个国家和地区的17所高校、科研机构签署了共建丝绸之路考古合作研究中心协议，聘请了来自9个国家的26位考古领域专家学者担任中心学术委员会委员。

主要任务是整合资源、搭建平台、创新发展，面向中亚、西亚、南亚，开展丝绸之路考古合作，是一个开放、合作、共享、传承的国际化平台。中心致力于与丝绸之路沿线国家学术机构合作，开展联合考古工作，研究丝绸之路的历史和古代东西方文明交往互动的过程，保护丝绸之路文化遗产，促进丝绸之路沿线国家的人文交流合作。目前，中心已与哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、乌兹别克斯坦、塔吉克斯坦、俄罗斯、蒙古、伊朗、巴基斯坦等8个国家和地区的10余所高校、科研机构签署了共建协议，并组建起中心学术委员会，聘请了来自9个国家的20余位考古领域专家学者担任委员，初步搭建起一个开放共享的学术合作交流平台。中心与各国学术机构联合培养丝绸之路考古与文化遗产保护领域的本科生、硕士生和博士生，共同建设多学科交叉融合、开放共享的国际联合实验室，并定期联合举办丝绸之路考古和文化遗产保护领域的国际学术研讨会。