中国共产党东南大学第十二次代表大会，是东南大学于2005年6月14日至15日召开的会议。

中国共产党东南大学第十二次代表大会是东南大学跨入21世纪后的第一次党代会，也是学校在迎接来自国内外各种机遇与挑战，全面推进高水平研究型大学建设进程的动员大会。

大会选举产生了第十二届党委会和纪委会，其中党委委员25人，纪委委员13人。

王志功、王保平、左惟、朱建设、刘波、刘乃丰、刘京南、刘鸿健、杨树林、时巨涛、吴应宇、沈炯、陆祖宏、易红、郑家茂、赵启满、胡凌云、胡敏强、袁久红、高建国、浦跃朴、谢伟江、谢建明、管平

2005年6月14日上午，党代会开幕。大会主席团执行主席左惟同志主持大会。大会由校长顾冠群同志致开幕词。随后，会议听取了胡凌云同志代表上届党委所作的党委工作报告和杨树林同志代表上届纪委所作的纪委工作报告。

2005年6月14日下午，党代会全体代表分16个代表团进行了分组讨论。

2005年6月15日下午，大会举行第二次全体会议，大会主席团执行主席杨树林同志主持大会。大会通过《中国共产党东南大学第十二次代表大会选举办法》，通过由大会主席团提名的总监票人和监票人名单。大会宣布了由大会主席团指定的计票人名单。到会的295名代表经过无记名投票，选举产生了新一届党委委员和新一届纪律检查委员会委员。闭幕式上，全体代表一致通过了《关于党委工作报告的决议》和《关于纪委工作报告的决议》。

中共东南大学第十二次代表大会是跨入21世纪后的第一次党代会，也是在迎接来自国内外各种机遇与挑战，全面推进高水平研究型大学建设进程的动员大会。通过这次大会，进一步总结了成绩和经验，明确了任务，统一了思想，增强了信心，振奋了精神，鼓舞了斗志，必将对学校今后的发展产生积极而深远的影响，必将以一次团结的大会、胜利的大会、鼓劲的大会载入东南大学发展的史册。