中国原子能科学研究院同位素研究所组建于1956年，是从事
放射性同位素研究的科研单位，是中国放射性同位素及其制品研究、试制、开发的主要基地。
2003年3月，随着中国原子能科学研究院同位素产业的重组，同位素研究所也进行了重新组建。现有职工62人，客座研究员3人。其中博士生导师3人，硕士生导师8人，高级
专业技术人员33人。现任所长罗志福，党支部书记何周国。
中国原子能科学研究院同位素研究所下设2个管理机构和3个研究单位，分别是：综合管理办公室、科技质量管理办公室、同位素制备和药物研究室（51室）、同位素技术研究室（52室）、特种同位素制品研制中心（53室）。
中国原子能科学研究院同位素研究所是“中国核学会同位素分会”、“中国同位素与辐射行业协会同位素专委会”和“
国家同位素工程技术研究中心”的依托单位，并与解放军军事医学科学院
毒物药物研究所共同建立了
标记化合物联合实验室。
中国原子能科学研究院同位素研究所自组建以来，在充分发挥 “四个平台”（专业委员会、中心和联合实验室）作用的同时，紧密围绕我国同位素技术及其应用领域的发展需求，积极创新，为提高同位素及其制品的制备和应用的技术水平、促进了同位素学科的建设、推动同位素事业的可持续发展作出了历史性贡献。
中国原子能科学研究院同位素研究所的主要任务是：承担国家科研项目、发展同位素学科、培养同位素领域高级专门人才；主要研究方向是
放射性同位素及其制品的研制，并探寻其在工业、农业、医学、国防和科研等领域的应用。主要从事：
中国原子能科学研究院同位素研究所拥有30MeV强质子
回旋加速器、Ge（Li）多道γ谱仪、
薄层扫描仪、气体色谱仪、
高效液相色谱仪、可见/紫外分析仪、成套原型源检验试验装置等仪器设备，以及配备有机械手的热室、工作箱、手套箱和从事
放射性核素及其制品研制的大型设施。