中国生态经济学学会的宗旨是团结全国生态经济工作者，遵守宪法、法律、法规和国家政策，遵守社会道德风尚，大力开展学术研究与交流，为繁荣和发展生态经济科学，为实现可持续发展作出贡献。
中国生态经济学学会挂靠在中国社会科学院和
中华人民共和国林业部，学会秘书处设在
中国社会科学院农村发展研究所生态与环境经济研究室，秘书处负责学会的日常工作。中国生态经济学学会下设10个专业委员会，分别是理论与发展专业委员会、农村生态经济专业委员会、林业生态经济专业委员会、区域生态经济专业委员会、城市生态经济专业委员会、资源与环境经济专业委员会、生态经济教育专业委员会、生态恢复专业委员会、工业生态经济与技术专业委员会、塌陷生态经济专业委员会。
中国生态经济学学会出版的刊物有：中国生态经济学学会和云南生态经济学会共同创办，在昆明出版发行的《
生态经济》；中国生态经济学学会和中国科学院石家庄农业现代化研究所共同创办，在石家庄出版发行 的《中国生态农业学报》；中国生态经济学学会和中国科学院寒旱所、西北师范大学主办的《生态经济学报》（季刊），在兰州出版发行；《生态经济通讯》为中国生态经济学学会内部通讯。
中国生态经济学学会成的主要工作包括：生态经济学术交流，组织生态经济课题研究；编辑出版有关生态经济杂志、书刊、资料；普及生态经济科学知识，积极传播生态经济方面的科研成果和经验；对涉及生态经济问题的科学技术政策和规划发挥咨询作用，积极提出合理化建议，经常向有关部门推荐研究成果，反映生态经济工作者的意见和呼声；积极开展国际学术交流活动方面进行了许多卓有成效的工作 。