中国社会科学院台湾史研究中心是中国社会科学院一个非营利性、非实体性的以台湾历史为研究对象的学术研究机构。

中国社会科学院台湾史研究中心成立于2002年9月28日，主要依托中国社会科学院近代史研究所台湾史研究室。

中国社会科学院台湾史研究中心的成立，意在推动、组织、协调台湾史的学术研究，从科学建设的角度，对台湾历史进行综合研究，开展与台湾、香港、澳门地区和国外学者的合作与交流，推动台湾史学术研究，为祖国统一与学术进步服务。

中心领导机构为理事会。中心成立时，中国社科院副院长朱佳木担任理事长，厦门大学台湾研究所原所长陈孔立、南京大学台湾研究所原所长茅家琦、中国社科院近代史研究所所长张海鹏担任副理事长。张海鹏兼任中心主任，主持中心工作。2016年12月28日，中心理事会换届，中国社会科学院副院长李培林担任理事长，中国社科院近代史研究所原所长张海鹏、现任所长王建朗担任副理事长，张海鹏继续担任中心主任，世界历史研究所所长汪朝光、近代史研究所副所长金以林担任副主任，近代史研究所台湾史研究室主任李细珠担任秘书长。中心秘书处设在中国社科院近代史研究所台湾史研究室，日常工作由近代史研究所管理。

中国社会科学院台湾史研究中心的主要任务是：组织、协调、推动台湾史研究，开展课题研究，开设学术讲座，定期或不定期地召开国内，或者海峡两岸以及国际性的学术会议，建设台湾史资料和信息中心以及数字化网络，为政府和社会各界提供学术咨询。