中国科学院大学（简称“国科大”）前身为中国科学院研究生院，是一所以
科教融合为办学模式、研究生教育为办学主体、精英化本科教育为办学特色的创新型大学，被誉为“世界顶尖科技学府”“中国科学家最多的大学”，2023年ESI最新数据中，
国科大全球排名26位，位列内地高校第一位。国科大杭州高等研究院（简称“杭高院”）创立于2019年，经中国科学院党组和浙江省委省政府批准，由国科大和杭州市合作共建，是国科大直属二级学院、杭州市直属正局级事业单位和浙江省首批省级新型研发机构。作为中国科学院体系在西子湖畔的一脉分支，杭高院秉承国科大“博学笃志、格物明德”的校训，继承和发扬中国科学院“科教融合”的传统优势，立足于“高起点、小而精”的办学定位，实施以人才培养为核心、以科学研究和创新创业为两翼的“一核两翼”发展战略，着力构建集“人才引育、学生培养、技术研发、成果转化”为一体的科技创新生态体系，坚持面向世界科技前沿和国家发展需要，以科技创新驱动产学研深度融合，助力区域经济社会高质量发展。
2019年4月28日，杭州市人民政府与
中国科学院大学市校合作签约活动在杭举行。全国人大副委员长、中国科学院副院长、中国科学院大学校长丁仲礼，浙江省人民政府省长袁家军见证签约。副省长成岳冲出席。杭州市市长徐立毅与中国科学院副院长、中国科学院大学党委书记
张杰签署市校
合作框架协议，中国科学院大学将支持杭州市建设杭州高等研究院。
2019年5月9日，国科大杭州高等研究院筹建工作座谈会暨高研院
揭牌仪式在
黄龙饭店举行。
2020年9月18日，杭高院迎来首批新生报到，国科大杭州高等研究院首届新生
开学典礼在云艺园区文体中心隆重举行。
2022年11月11日，当选为“杭州市
新型研发机构联盟”执行理事长单位。11月16日，国科大杭州高等研究院启动了基于多种国际
前沿技术、聚焦多维
精准营养和健康评估干预的“人体营养与代谢研究平台”。
杭高院坚持以打造一流人才聚集的教科研队伍作为建设重要支撑，依托中国科学院优质人才资源，科学构建“全职+双聘+博士后”的引才体系。现有教职员工762人，其中岗位教授267人、教学科研岗121人、管理支撑岗202人、在站博士后172人。教学科研人员121人中，共有国家级领军人才3名、国家级“四青”人才5名、海外优青2名、省市级海内外高层次人才19名；毕业于中国科学院系统、985高校及全球百强高校的占比78.5%，有海外学习工作经历的占比38.8%，高级职称占比54.5%。岗位教授267人中，共有院士15人、国家级领军人才68人、国家级青年人才99人。截止至2023年11月，博士后累计进站280人，杭高院博士后工作站已获批国家级博士后科研工作站，2023年取得独立招收博士后研究人员资格。
杭高院始终把人才培养作为办学根本任务，积极打造具有杭高院特色的教学和培养体系。在“工学”“理学”和“医学”三大学科门类下招收研究生，获批光电信息工程、计算机技术、人工智能等8个专业学位领域培养点。截至2023年10月，杭高院共有在学硕博研究生近2000名。以培养“世界前沿科学技术的引领者、自主核心技术的研发者、新型产业发展的驱动者”为目标，集聚中国科学院优质科教资源参与研究生全过程培养。由
王建宇、
江桂斌、
俞飚、
唐勇、
李劲松等院士领衔的国家级领军人才走进课堂授课已成常态。举办HIAS讲堂，邀请各领域顶尖专家加入讲授团队，优质教育资源“引进来，走出去”双轨并行，线上线下辐射人数超百万。在高水平科研实践中培养人才，将深空引力波探测、南极科考等国家级科研项目作为研究生学习任务。作为国科大京外学院中第一批成功培养毕业生的单位，杭高院首届200名毕业生中意向就业学生实现全部就业，留杭就业升学率逾50%。
杭高院实施“一核两翼”发展，即以通过引育“国际化、创新型、创业型、复合型”的
高层次人才，构建开放、共享的
高层次人才培养基地为“核心”；以构建围绕支撑“
第四次工业革命”的“物理信息”“生命健康”和“智能科技”三大领域开展
前沿科技研究的
科研创新基地，构建支撑服务中科院所有下属机构不同层级
科研人员在杭从事创新创业活动的新产业孵化基地为“两翼”。杭高院精心谋划，以杭州市经济社会发展需求为导向，立足自身发展实际，研究制定了《 国科大杭州高等研究院三年行动方案（2023-2025）》，全力实施高水平人才培养、高质量科技创新、高层次师资引育、高效能产业转化、高能级平台建设和高级别国际合作六大行动。面向未来，杭高院将认真贯彻落实习近平总书记对中国科学院提出的“四个率先”和“两加快一努力”要求，守正创新、踔厉奋发，努力建设成为中国特色、世界一流的新型教学科研机构。在培养新型科技人才、攀登科学高峰的同时，以高质量的科研创新成果支撑高水平科技自立自强，以高标准的人才培养赋能一流人才高地建设，为助力杭州进入国家战略科技力量第一方阵作出更大贡献。
围绕物理光电、生命健康、智能科技和生态环境四大前沿领域，依托12家中国科学院科研院所，杭高院建有基础物理与数学科学学院、物理与光电工程学院、化学与材料科学学院、生命与健康科学学院、药物科学与技术学院、环境学院、分子医学院、智能科学与技术学院等8个学科交叉型二级学院，下设69个教授工作室和25个科研平台。拥有浙江省引力波精密测量重点实验室（引力波宇宙太极实验室）和浙江省系统健康科学重点实验室（中国科学院系统生物学重点实验室）2个省部级重点实验室。
杭高院现有云艺院区、谷鼎院区、青和院区三个院区，主院区双浦院区毗邻铜鉴湖，风景秀丽；紧邻地铁6号线双浦站，交通便利。双浦院区一期建筑面积约55.5万平方米，包括教学科研、学术交流、宿舍公寓等功能区，计划容纳硕博研究生4500名、博士后及教职工近2000名。