中国科学院核酸生物学重点实验室是中国科学院下属的实验室。
2011年10月，为进一步拓展核酸生物学研究，中国科学院生物物理研究所正式成立了非编码核酸所级重点实验室，命名为“生物物理所非编码核酸重点实验室”。
2013年6月，经北京市科委批准，实验室跻身北京市重点实验室行列，命名为“非编码核酸北京市重点实验室（2013年-2016年）”，以中国科学院生物物理研究所为依托单位。
2014年8月，经中国科学院批准，实验室跻身中国科学院重点实验室行列，命名为“中国科学院核酸生物学重点实验室”，以中国科学院生物物理研究所为依托单位。
中国科学院核酸生物学重点实验室的主要发展目标是，围绕RNA丰富的生物学功能开展创新性研究，力争成为国际一流的RNA研究中心。
中国科学院核酸生物学重点实验室的主要研究方向是，非编码RNA的系统发现；非编码RNA的生物学功能；由RNA和蛋白质共同实现的“双色”生物调控网络；RNA蛋白质复合物的结构和功能；RNA的修饰和加工；RNA在发育和疾病中作用；RNA研究的新技术。