中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（Center for Excellence in Brain Science and Intelligence Technology，简称CEBSIT）是中国科学院在2014年首批成立的四个卓越创新中心之一。作为中科院体制与机制改革的试点，卓越中心是跨学科、跨院校的组织。

1999年11月27日，中国科学院神经科学研究所成立，蒲慕明任所长。

2003年11月29日，中国科学院神经科学研究所第一次研究组国际评估。

2007年8月7日，神经科学国家重点实验室批准筹建。

2009年6月1日，中国科学院神经科学研究所成立非人灵长类平台。

2013年7月10日，部分实验室搬迁至新建成的生命科学实验楼。

2014年1月21日，中国科学院脑科学卓越创新中心成立。

2015年6月5日，融合智能技术领域，更名为中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心。

2018年2月25日，国际灵长类脑研究中心成立。

据2023年7月官网数据，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心有研究员49人、青年研究员3人。

研究员（49人）：ANGELOVSKI Goran、蔡时青、常乐、陈跃军、杜久林、龚能、顾勇、何杰、黄薇、EVRARD Henry、李澄宇、李毅、梁智锋、刘赐融、刘丹倩、刘真、刘佳男、刘静宇、刘志勇、毛盾、穆宇、OKAZAWA Gouk、蒲慕明、孙衍刚、KAPOOR Visha、汪菲、王凯、王立平、王伟、王佐仁、熊志奇、徐敏、徐宁龙、徐春、徐圣进、许晓鸿、肖雄、严军、杨辉、杨天明、姚海珊、叶铮、俞青、喻晓、张哲、赵郑拓、周海波、周嘉伟、竺淑佳

青年研究员（3人）：李雪、孙怡迪、周昌阳

据2023年7月官网数据，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心拥有重点实验室2个。

重点实验室（2个）：神经科学国家重点实验室、中国科学院灵长类神经生物学重点实验室

据2023年7月官网数据，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心拥有6个专业技术平台、3个实验动物平台、8个研究平台以及1个技术支撑平台。

2021年3月18日，由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、神经科学国家重点实验室主办的第四期睡眠研究前沿论坛在A2420会议室举行。论坛以“睡眠-觉醒的神经环路”为主题，重点探讨近年来研究发现的不同脑区及不同类型神经元对睡眠-觉醒行为的调控。

中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心的研究工作包括五个领域：

在“脑认知功能的环路基础”领域，中心将研究感觉输入是在大脑中分析整合、如何启动动作环路、如何调节动物的本能行为，自发活动的意义和对感觉信息处理、感觉/动作转换机制的作用、记忆储存与提取的神经机制、适应性行为和高级认知功能（如自我意识、共情心、合作行为和语言等）的神经环路基础。要全面理解大脑的这些功能，必需在介观层面解析全脑各类神经元的联接结构和电活动规律。

在“脑疾病机理与诊断干预”领域，中心将关注各种脑疾病的致病机理，研发早期诊断的指标和早期干预发病过程的手段。

在“脑研究新技术”研究方向，中心正在完善鉴别神经元类型的单细胞基因分析方法、病毒感染示踪标记神经环路的方法、记录电信号和化学信号的微电级阵列技术、以及各种观测脑结构和功能的光学、磁共振影像新技术。

在“类脑模型与智能信息处理”研究方向，中心在微观、介观和宏观多尺度水平进行全脑神经联接结构和功能分析，研发能实现多模态感知、节能高效和可泛化的机器学习算法。

在“类脑器件与系统”研究方向，中心将研发类神经元计算芯片、新一代的神经网络计算器件、类脑智能机器人、以及人机协同的智能训练和生长环境。

2021年9月21日，《Cell Reports》期刊在线发表题为《小脑去极化扩布介导发作性运动障碍》的研究论文，该项研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中心熊志奇研究组完成。

2022年10月8日，《Neuroscience Bulletin》期刊在线发表题为《试次历史对间隔计时行为的影响》的研究论文，该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中心姚海珊研究组完成。

2023年4月6日，《Genome Biology》期刊发表了题为《Reading and writing of mRNA m6A modification orchestrate maternal-to-zygotic transition in mice》的研究论文，该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）刘真研究组、孙怡迪研究组与上海交通大学医学院单细胞组学与疾病研究中心李辰研究组合作完成。

《Neuroscience Bulletin》（《神经科学通报》英文刊）是由中国科学院主管，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心主办和出版的学术型单月刊，致力于反映神经科学领域的前沿研究，发表关于神经科学研究领域广泛主题的文章，关注神经系统调节运转机制和神经系统疾病的发生发展机制。该刊主要刊登原始研究论文（Original Article）和综述（Review），同时设有实验方法（Method）、读者来信（Letter to the Editor）和研究亮点（Research Highlight）等栏目。

中国科学院脑科学与智能制造卓越创新中心院徽上方为卓越中心的中文全称字样，下方为卓越中心的CEBSIT·CAS英文字样，院徽中央为大脑，左侧为电路，右侧为右脑，代表着智能技术与脑科学领域。

2023年5月13日，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心以“脑智擘未来”为主题，策划能让公众与科学亲密接触的活动。