根据《
国家科学技术奖励条例》的精神，结合高等学校情况，2000年教育部设立中国高校科学技术奖励委员会。中国高校科学技术奖励委员会设立中国高校科学技术奖，分设中国高校自然科学奖、中国高校技术发明奖、中国高校
科学技术进步奖；设一等奖、二等奖两个等级；每年评审、授予一次。中国高校科学技术奖授予在科学发现、技术发明和科学技术进步方面做出突出贡献的科技工作者和单位。
中国高校科学技术奖由中国高校科学技术奖励委员会颁发证书和奖品。由于该项奖励是全国高校在同一舞台上展示自己的实力，各高校都非常重视，汇集了全国高校特别是重点高校的优势项目；同时由于授奖数量比原教育部科技进步奖大幅度减少，竞争异常激烈。
所有推荐项目须由学校学术委员会负责对项目的水平、创新性、社会和经济效益、推荐等级进行评价、推荐，除教育部部属高校直接向教育部推荐外，其它所有高校均归口由各省、自治区、直辖市教委负责审查、推荐。