中山大学胃肠病学研究所隶属于中山大学附属胃肠肛门医院（即中山大学附属第六医院）。于2007年3月通过中山大学学术委员会集体论证后成立，作为与该专科医院相匹配的胃肠病学研究基地。

中山六院胃肠外科是中山大学普通外科国家重点学科的重要组成部分，是国家最早的硕士、博士学位授予点之一。研究所着重研究胃肠领域的主要疾病，如消化道肿瘤、炎性肠病、结直肠肛门良性疾病、肠内与肠外营养等。同时，该研究所还承担本院其他专科的科研任务。

?研究所拥有强大的研究梯队，有教授6人，副教授8人，讲师15人，在读博士13人，硕士3人。学术骨干先后分别在美国哈佛大学麻省总医院、安德森肿瘤中心、康奈尔大学医学中心、梅约医学中心、约翰霍普金斯医院、克利夫兰医院，日本神户大学医学院、日本高野病院，澳大利亚皇家墨尔本医院，新加坡中央医院，香港大学玛丽医院等进行长期访问学习。并与国外多个著名的胃肠疾病中心、研究所建立了长期友好的双边交流和合作关系。科研水平与国际水平同步。

首任所长汪建平教授为中山大学副校长、中山大学附属第六医院（胃肠肛门医院）院长，同时担任的其他学术职务包括中华医学会结直肠肛门外科学组组长、《中华胃肠外科杂志》主编、《外科学》第七版本科生教材副主编、中华医学会理事、中华医学会外科学会委员、广东省医学会副会长、胃肠外科与营养支持学组组长。常务副所长王磊副研究员，为中山大学胃肠外科硕士、博士，2001年至2005年在美国M.D.Anderson肿瘤中心从事博士后研究，在癌基因、抑癌基因与肿瘤发生发展机理上有着系统深入的研究，多篇高SCI分值的文章在国际肿瘤学权威杂志如Cancer Research、Oncogene等上发表。副所长兰平教授，中山大学胃肠外科博士，2000年至2003年在美国明尼苏达大学及哈佛大学麻省总医院从事博士后研究，多篇文章在Blood等国际权威杂志上发表。担任的主要学术职务包括中华医学会结直肠外科学组委员兼秘书、《中华胃肠外科杂志》副主编等。

??研究所位于中山六院4号楼，占地面积约800平方米。主要包括中心实验室、数据库、随访科、病理科及组织库、临床检验中心。承担的科研基金课题包括国家“九八五”计划基金、国家自然基金、教育部博士点基金、教育部回国人才基金、卫生部杰出人才基金、广东省自然基金重点项目、广东省自然基金、广东省科技厅基金、广东省卫生厅基金、中山大学“211工程”重点学科建设基金等。