1995年10月8日正式颁布实施新宪法，2005年11月修改。规定总统由直接选举产生，任期5年，无任期限制。

1995年10月8日正式颁布实施新宪法，2005年11月和2017年12月两次修改。规定总统由直接选举产生，任期5年，无任届限制；议会有权弹劾总统和罢免不称职的部长，总统的重大任命、决定和签署重要条约均应先经议会批准；成立由部分内阁成员和议员组成的国务委员会，负责解决政府与议会之间的矛盾，出现政治危机时充当总统顾问，并代表议会批准总统的任命。

约韦里·卡古塔·穆塞韦尼：总统兼武装部队总司令、全国抵抗运动组织主席。1944年出生，巴尼安科莱人。1966至1969年在坦桑尼亚达累斯萨拉姆大学攻读政治经济学，获学士学位。1970年回国后任奥博特总统府研究助理秘书。1971年阿明上台后流亡坦桑，参加反对阿明的斗争。1979年阿明被推翻后任全国解放阵线执委兼军委会副主席，历任国防国务部长、国防部长和地区合作部长等职。1980年创建“乌干达爱国运动”。1981年6月，穆与卢莱共同创建“乌干达全国抵抗运动”，先后任副主席、临时主席、主席。1986年1月推翻奥凯洛军政府，就任总统兼国防部长、武装部队总司令。1996年5月在乌首次全民大选中当选总统，2001年3月、2006年2月、2011年2月和2016年2月四次蝉联。曾于1989年、1996年和2004年访华，2006年11月来华出席中非合作论坛北京峰会，2015年3月来华进行国事访问并出席博鳌亚洲论坛2015年年会，2018年9月来华出席中非合作论坛北京峰会，2019年6月来华工作访问。已婚，有三女一子。

1、穆特萨二世（Frederick Mutesa II）1963年10月9日—1966年3月2日卡巴卡耶卡党

代总统米尔顿·奥博特（Milton Obote）1966年3月2日—1966年4月15日 乌干达人民大会党

2、米尔顿·奥博特（Milton Obote）1966年4月15日—1971年1月25日乌干达人民大会党

3、伊迪·阿明·达达（Idi Amin）1971年1月25日—1979年4月11日军人

代总统优素福·卢莱（Yusuf Lule）1979年4月11日—1979年6月20日无党派

4、戈弗雷·比奈萨（Godfrey Binaisa）1979年6月20日—1980年5月12日乌干达人民大会党

军事委员会主席保罗·穆万加（Paulo Muwanga）1980年5月12日—1980年5月22日乌干达人民大会党

总统委员会（1980年5月22日—1980年12月15日）

5、米尔顿·奥博特（Milton Obote）1980年12月17日—1985年7月27日乌干达人民大会党

代总统巴西利奥·奥拉拉-奥凯洛（Bazilio Olara-Okello）1985年7月27日—1985年7月29日军人

军事会议主席蒂托·奥凯洛（Tito Okello）1985年7月29日—1986年1月26日军人

6、约韦里·穆塞韦尼（Yoweri Museveni）1986年1月26日—今全国抵抗运动组织