九阳真经乃金庸武侠小说中最高深的武学宝典之一，是与佛家的《易筋经》和道家的《九阴真经》等并驾齐驱的至高无上武学瑰宝。

在小说《倚天屠龙记》最早连载版中，《九阳真经》、《九阴真经》均为达摩所著，《九阳真经》虽然只有内功的修炼方法，但神功大成后，却非世上的任何武功招式所能伤害。

修订版中，小说《九阳真经》相传为达摩祖师所写下的，但后来张君宝悟到达摩祖师是天竺人，就算会写中华文字，也必文理粗疏，九阳真经文字佳妙，外国人决计写不出，定是后世中土人士所作。多半便是少林寺中的僧侣，假托达摩祖师之名，写在天竺文字的《楞伽经》夹缝之中。

在新修改版本中，作者写成在嵩山中一位无名奇士斗酒胜了「中神通」王重阳得以借观《九阴真经》，此人即斗酒神僧，某天与王重阳斗酒后胜于王重阳，王重阳便把《九阴真经》借给斗酒神僧看。斗酒神僧认为《九阴真经》阴气太重，一味崇扬道家黄老之学，只重以柔克刚，以阴胜阳，不及阴阳互济之妙，于是投身少林，在四卷《楞枷经》行缝中，以汉文写下了自己结合武道禅宗心得所创的，写下自创的《九阳真经》，自觉比之与《九阴真经》更有阴阳调和、刚柔互济的中和之道，撰写《九阳真经》的斗酒神僧在皈依佛法之前乃是道士，精通道藏，所撰武经刚柔并重，阴阳互济，随机而施，后发制人，与少林派传统武学的着重阳刚颇不相同，与纯粹道家的九阴真经之着重阴柔亦复有异。于是顺理成章出现在少林寺藏经阁。

新修版《射雕英雄传》的《九阴真经》总旨亦明言「九阴极盛」乃是灾害，要纠正道家「但重阴柔的缺失」，然而，如《射雕英雄传》中所述，总旨「比之真经中所载的功夫更深了一层」，可见黄裳虽认为「阴阳互济」是「武学最高境界」，作为九阴难以明解的关锁的总钥匙，或克服「九阴极盛」的毛病，却未改《九阴真经》所载武功本身阴柔为主的特性，故两书所述并无矛盾。

奇士所创，可视为《九阴真经》总纲所见上另建高筑，修炼《九阳真经》，可达到《九阴真经》总旨中所述「武学至高境界」。《九阳真经》练到最后大关得名师指点或友人帮助，打通全身上下所有几百个穴道，冲破全身上下数十处玄关，才真正练成「九阳神功」，或如张无忌那般在「乾坤一气袋」中的奇遇，否则只是积存九阳内力，不会施展运用，内力不会无穷无尽的循环自生，剧烈战斗后容易泄气过度致死，如同觉远大师的例子。

重见天日

在《神雕侠侣》中，杨过打败金轮法王（新修版改称「金轮国师」），蒙古武士尹克西和潇湘子逃到嵩山，后发现张君宝（孩童时期的张三丰）在少林寺廊下读《楞伽经》，尹克西悄悄走到他身后，伸手点了他的穴道，把那四卷《楞伽经》取去。

经在油中

后来，觉远和张君宝追赶尹克西和潇湘子二人至华山之巅，巧遇杨过、小龙女、郭襄等人。尹克西和潇湘子眼看无法脱身，刚好身边有只苍猿，两人心生一计，便割开苍猿肚腹，将经书藏在其中。觉远、张君宝、杨过等搜索潇湘子、尹克西二人身畔，不见经书，便放他们带同苍猿下山。潇湘子和尹克西带同苍猿，远赴西域，两人心中各有所忌，生怕对方先习成经中武功，害死自己，互相牵制，迟迟不敢取出猿腹中的经书，最后来到昆仑山的惊神峰上，尹湘两人互施暗算，斗了个两败俱伤而死。这部修习内功的无上心法，从此留在苍猿腹中。

尹克西临死时遇见「昆仑三圣」何足道，良心不安，请他赴少林寺告知觉远大师，那部经书是在这头苍猿的腹中。但他说话之时神智迷糊，口齿不清，他说「经在猿（yuan）中」，何足道却听做什么「经在油（you）中」。何足道信守然诺，果然远赴中原，将这句「经在油中」的话跟觉远说了。觉远无法领会其中之意，固不待言，反而惹起一场绝大的风波，令觉远、张君宝被少林寺所逐。觉远圆寂前，念起《九阳真经》，令郭襄、张君宝和少林寺罗汉堂首座无色禅师各有所悟，无色得其高（因三人中武功最高并与其本身武功印证），郭襄得其博（因家学渊博，所学甚广），张君宝得觉远传授《九阳真经》最多，加上当时武功全无根基，所学反而最精纯。三人各以此为基础，创出了少林九阳功、峨嵋九阳功、武当九阳功。后来郭襄、张君宝出家开创峨嵋、武当两派。

在《倚天屠龙记》中张无忌因朱子柳的后代朱长龄的牵连意外地进入昆仑山谷，巧遇当年的苍猿，因好心治疗其肚腹上的伤痕，取出内藏之经书，得以习得完整的九阳神功，不但缠绵体内的寒毒尽皆驱除，内力更提升至绝高的境界。九阳神功到最后大关时得到「乾坤一气袋」的奇遇后，冲破全身上下数十处玄关，张无忌的九阳神功方克大成。

「他强任他强，清风拂山岗；他横任他横，明月照大江。」

「他自狠来他自恶，我自一口真气足。」

第二卷经文中：「呼翕九阳，抱一含元，此书可名《九阳真经》。

在张无忌走进昆仑山谷的五年后，他完全学会了九阳真经，于是把四卷载有《九阳真经》的《楞伽经》、以及胡青牛《医经》、王难姑