昆明郑和船工足球俱乐部原名云南昆陆足球运动俱乐部，注册成立于2017年8月25日，2021年1月19日更名昆明郑和船工足球俱乐部。2018年9月11日，俱乐部被中国足球协会认定为“全国社会足球品牌青训机构（2018-2020）”，2019年俱乐部获评云南省足球协会优秀青训机构。2022年4月25日，俱乐部宣布退出中国足球协会乙级联赛。