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云南民族大学学报：自然科学版》主要栏目：基础理论及应用基础研究、应用技术研究、综述、科研简讯、计算机技术与应用、数理经济与技术经济。
主要刊登基础学科和工程技术的研究性学术论文。目前栏目有：化学与生物、民族药资源、数学及应用数学（经济、金融等方向）、信息与计算机、电子电气与自动化、网络与通信技术、无线传感器网络技术、物理及相关学科、教育技术、体育研究、图书情报与文献学等。
自创办以来，始终坚持“立足民族问题研究，关注当代经济社会发展中的重大理论与现实问题”的办刊宗旨和方向。常设“民族政治研究”“民族学·人类学理论与实践”“民族社会学研究”“民族经济研究”和“历史研究”等栏目，重点选用主题鲜明、前瞻性强、资料翔实、层次清楚、论证充分的学术研究成果。