云南省药物研究所始建于1956年，是一所专门从事云南丰富天然药物研究开发的科研机构。2000年科技体制改革，云南省药物研究所转制为国有全资企业。现隶属于
云南白药集团股份有限公司。现隶属于云南白药集团股份有限公司。转制以来，药物所继续承担着药物研究及其相关技术领域的科研工作，兴办产业实体（制药厂）联动发展，现拥有优良资产1.4亿元（不包括无形资产），其中药品生产GMP车间、
GLP实验室及研究用房约15000平方米，高端配置的科研仪器、生产设备计400多台套，高级技术职称及博士、硕士占职工总数的26%，是生物医药
高新技术企业。为国家级企业技术中心、国家火炬计划重点高新技术企业、西南民族药新产品开发国家地方联合工程研究中心、昆明国家生物产业基地生物医药中试生产中心—中药、天然
药物制剂中试生产平台。人才建设被
云南省科技厅认定为天然药物研发领域云南省创新团队。2009年，受到国家科技部中药现代化科技产业基地建设十周年优秀单位表彰。
数十年坚持不懈，科技人员走遍云南山水，遍访民族民间，开展云南天然药物资源调研和民族民间用药经验的收集，编研出版了《
云南天然药物图鉴》、《
云南重要天然药物》、《云南民族药志》、《滇南本草（增补本）》等4部10余卷药学专著。2011年，“低纬高原地区（云南）天然药物资源调查及研究开发”荣获云南省科技进步特等奖，被评选为云南十大科技进展；2012年，“低纬高原地区天然药物资源调查与研究开发”项目荣获国家科技进步一等奖。
建所以来，药物所先后主持和参与研发出30余个原创新药，包括青蒿素（国家发明奖排名第三）、灯盏花系列（灯盏花素注射液、
灯盏细辛注射液、
灯盏花素片、益脉康）、三七系列（三七总皂苷、
血塞通注射液、
三七冠心宁、七叶神安片）、金品系列药物（痛舒胶囊（片）、
肿痛气雾剂、肿痛搽剂、肿痛凝胶、
伤益气雾剂）等，研究成果实现产业化。获国家和省部级以上奖励达40项，为祖国医药卫生事业和云药产业发展做出了贡献。