交叉污染是指饲料在加工、运输和贮藏过程中，不同饲料原料或饲料产品之间发生的相互污染。

交叉污染 cross contamination

当一种产品或一个物质中，存在不需要的物质时，就是污染。

交叉污染：不同原料、辅料及产品之间发生的相互污染。

食品卫生法第八条第（四）款规定“设备布局和工艺流程应当合理，防止待加工食品与直接入口食品、原料与成品交叉污染，食品不得接触有毒物、不洁物”。前面所提到的交叉污染是指在食品的生产加工及销售过程中，由于设备布局及工艺流程不合理，前工序食品的原料、半成品通过食品加工器械、容器及食品加工人员污染了后工序的半成品和成品。在一定条件下，有害细菌便会大量繁殖增长，人食用了含有这种细菌的食品就可能造成食物中毒或其他食源性疾病的发生。

在GMP认证中要防止交叉污染，包括不同类别药物之间的交叉污染、人流和物流的交叉污染以及空气之间的交叉污染等。