1955年7月，伊克昭盟人民政府改称伊克昭盟人民委员会，仍作为内蒙古自治区人民委员会领导下的一级地方政权。盟人民委员会下设办公室、民政处、公安处、财政处、文教处、人事处、卫生处、工业处、商业处、农牧处、税务局、粮食局、计划委员会、体育运动委员会、监察委员会、财经委员会、协商委员会、统计科、交通科、林业科等工作部门。时辖东胜县、达拉特旗、准格尔旗、郡王旗、札萨克旗、杭锦旗、乌审旗、鄂托克旗

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1958年5月，伊克昭盟人民委员会改称伊克昭盟行政公署，为内蒙古自治区人民委员会的派出机构，不再行使一级地方政权的职能。至1966年4月，伊克昭盟行政公署先后设有计划委员会、办公室、人事处、民政处、物资局、统计局、劳动局、物价科、建设科、计划一科、计划二科；工业交通委员会、农牧业机械管理处、手工业管理处、邮电办事处、工业科、交通科；农牧林水委员会、农林处、畜牧处、水利水保处、气象局、安置办公室、计划财务科、农牧场管理科；文教委员会、文化科、教育科、卫生科、科技委员会、科技协会、体育运动委员会、计划生育委员会、财贸委员会等工作部门。时辖达拉特旗、准格尔旗、伊金霍洛旗、杭锦旗、乌审旗、鄂托克旗、东胜县、海渤湾市。