2017年2月21日，2017年全国春季游泳锦标赛，男子1500米自由泳比赛中，何峻毅获得亚军。6月23日，2017年
全国夏季游泳锦标赛暨全运会预选赛，在男子200米自由泳中，何峻毅以1分50秒70获得季军。10月20日，2017年
全国游泳锦标赛，在男子1500米自游泳中，何峻毅以15分53秒64获得第三，在男子100自游泳中，何俊毅以50秒29获得第三。
2018年1月21日，2018年全国春季游泳锦标赛男子100自游泳，何峻毅以49秒90获得冠军，男子200米自游泳，何俊毅以1分50秒32获得冠军。4月15日，2018年全国游泳冠军赛，在男子50米自由泳决赛中，何峻毅以22秒60获得第三。8月6日，何峻毅入选第十八届亚运会中国体育代表团名单。10月16日，2018年全国游泳锦标赛男女4×100混接力决赛，何峻毅组成的浙江队以3分54秒54获得第三。10月14日，男子4×100米混合接力中，何峻毅的队伍获得金牌，10月16日，在男子4×100米自由泳接力中，何峻毅的队伍以3分54秒54获得金牌；男子50米自由泳决赛中，何俊毅以22秒73获得第二名；男子100米自由泳决赛中，何俊毅以49秒41获得第二名。10月12月，何俊毅参加2018年短池游泳世锦赛。
2019年3月28日，2019年全国游泳冠军赛暨世锦赛选拔赛，在男子100米自由泳中，何俊毅以48秒10获得冠军，打破他在半决赛创造的48秒29的个人最好成绩。7月8日，何峻毅入选2019年游泳世锦赛参赛名单。10月19日，在第七届世界军人运动会游泳比赛，在男子4×200米自由泳接力决赛中，何峻毅组成的中国队以7分13秒35的成绩夺得冠军，并打破国际军事体育理事会纪录。10月22日，男子4×100米混合泳接力，何峻毅组成的队伍以3分34秒44的成绩获得亚军。
2021年1月3日，河北奥体中心游泳馆举行的中国游泳争霸赛，男子100米自由泳决赛中，何峻毅以48秒57夺冠，拿到奥运A标；7月6日，何峻毅入选2020年东京奥运会中国体育代表团游泳项目运动员名单。9月20日，在第十四届全运会男子4×100米自由泳接力决赛中，何峻毅组成的浙江队以3分13秒53的成绩获得冠军。5月5日，全国游泳冠军赛暨东京奥运会选拔赛，在男子100米自由泳决赛中，何峻毅以48秒71的成绩获得冠军。7月30日，何峻毅组成的中国队在东京奥运会游泳男子4×100米混合泳接力预赛中排名第四，晋级决赛。8月1日，男子4x100米混合泳接力决赛中，何峻毅所在的中国队以3分30秒59的成绩获得第7名。随后，中国队出现犯规成绩被取消。9月23日，中华人民共和国第十四届运动会游泳男子100米自由泳金牌。9月26日，游泳男子4×100米混合泳接力第1名。
2024年8月26日，全国夏季游泳锦标赛男子50米自由泳决赛，何峻毅以22秒29夺冠。9月24日，2024年全国游泳锦标赛男子4x100自由泳接力决赛，何峻毅组成的浙江队以3分09秒10的成绩打破全国纪录并夺冠。9月27日，男女4X50米自由泳接力决赛，何峻毅组成的浙江寿仙谷队以1分31秒10的成绩获得冠军。9月29日，2024年全国游泳锦标赛（25米）男子4x100米混合泳接力决赛中，助力浙江寿仙谷队以3分27秒62的成绩获得冠军。
在短距离自由泳项目中，大半个身位的优势是相当明显的。这几年他进步快，正处于竞技能力、训练水平等各方面的上升期。（中国国家游泳队教练
朱志根评）