建于明正德十一年（1516年），清时重修。后来据民国时调查，保福寺占地约二亩，有九间瓦房，土房两间，泥像九尊，另有石碑两座，井一眼，楸柳四棵。被乡政府及小学占用。

保福寺所在的村子亦称保福寺，又名保福寺村。建国以后，中国科学院在此设所建宿舍，此地发生了巨大变化，成为中关村的核心。中国科学院计算机网络信息中心、中国科学院工程热物理研究所、力学研究所、电工研究所、自然科学史研究所、过程工程研究所、声学研究所、数学与系统科学研究院、软件研究所、计算技术研究所、物理研究所、理论物理研究所、自动化研究所、国家空间科学中心、理化技术研究所等研究单位驻于该区域。

东起京包铁路（清华园车站），西至科学院南路，北邻三才堂，南抵知春路。

《日下旧闻考》引《五城寺院册》曰：“南海淀之东二里许有保福寺。”建于明正德十一年（1516），清时重修。据民国时调查，此寺占地二亩零四厘，有九间瓦房，土房两间，附近属瓦房一间。“泥像九尊，铁五供一堂，另有石碑两座，井一眼，楸柳四棵。”属合村公建。被村公所及小学占用。原有鼐公禅师灵塔，三十年代塌了一半，但仍有香火。新中国成立以后，中国科学院在此设研究所，建宿舍。从此保福寺的地名便逐渐隐退，中国科学院则成了中关村的核心。

中国科学院计算机网络信息中心、中国科学院工程热物理研究所、力学研究所、电工研究所、自然科学史研究所、过程工程研究所、声学研究所、数学与系统科学研究院、软件研究所、计算技术研究所、物理研究所、理论物理研究所、自动化研究所、国家空间科学中心、理化技术研究所等研究单位驻于该区域。