龙川始柱角鹿(Eostyloceros lungchunensis)
更新世早期的种类,元谋狼(Canis yuanmoensis)、鸡骨山狐(Vulpes cf.chikushanensis)、化石小灵猫(Viverxicula malaccensis fossils)、桑氏鬣狗(Hyaena licenti)、昭通剑齿象(Stegodon zhaotongense)、元谋剑齿象(Stegodon yuanmoense)、类象剑齿象(Stegodon elephantoides)、云南马(Equus yunnanensis)、中国犀(Rhinoceros sinensis)、复齿短耳兔(Ochotonoides complicidens)、山西轴鹿(Axis shansius)、粗面轴鹿(Axis cf.rugosus)、斯氏鹿(Rusa stehlimi)。
元谋动物群中除个别现生种外,其余均为绝灭种。元谋动物群同华南各地的大熊猫—剑齿象动物群有一定的联系,如中国犀、化石小灵猫在两个动物群中均存在,但大熊猫—剑齿象动物群中的一些典型种类,如大熊猫、中国熊、猩猩及猕猴等,在元谋动物群中却没有发现。元谋动物群与华北三趾马动物群及
泥河湾动物群有较密切的联系。如桑氏鬣狗、泥河湾剑齿虎、爪兽、复齿短耳兔、山西轴鹿、粗面轴鹿等同样存在于泥河湾动物群中。云南东北部昭通地区发现的昭通动物群(Zhaotong fauna),时代为更新世,相当于元谋动物群。