克隆选择（Clonal selection）又称株落选择，于1957年由澳大利亚的Burnet和Jerne共同提出。

他认为免疫细胞可以随机生成多样性的克隆，每一个免疫细胞的克隆表达针对某一个特定抗原的特异性的（Specific）受体（Receptor）。对于某一特定抗原，该抗原与表达其特异性受体的免疫细胞发生特异性结合，导致此种免疫细胞被活化并大量扩增。不同的抗原活化不同的免疫细胞克隆。免疫耐受（Immunological tolerance）是由于免疫细胞克隆发生了夭折，即与自身抗原结合的免疫细胞在扩增的前体细胞（Precursor or Progenitor）阶段发生了流产。

造血干细胞：可分化成未成熟淋巴细胞。

未成熟的淋巴细胞：这些细胞拥有许多不同抗原的受体。

未成熟的淋巴细胞：拥有可与来自自身的抗原结合之受体的细胞将被移除。

形成未活化的淋巴细胞。

只有外来抗原可活化这些细胞。