全台铁路商务总局是
清朝福建台湾省首任巡抚
刘铭传奉准“修铁路、创办商务”后于光绪十三年（1887年）在台设立的机关之一，一说正式全名为全台轮船铁路商务总局，又称为商务局、台北通商总局[注 2]，而传世关防铭文为“办理台湾商务总局关防”。
商务局于光绪十三年（1887年）成立时，初由
林维源为商务督办，后因林维源已兼办台北抚垦事务，改由杨宗瀚督办商务。该局除了处理铁路兴建事宜外，也在上海旗昌洋行经手下购买两艘快船，分别名叫“斯美”与“驾时”；“斯美”专门来往台湾与上海、福州，“驾时”则专门航行于香港、厦门一带。后来铁路开工不久后，杨宗瀚因病假归，遂委任张士瑜为总理。而根据台湾总督府铁道部采访杨怀瑾（曾任票房司事）所得到的记录，商务局内原先设有文案、帐房、书班，后来又增加收发处、收课银与翻译的编制。此外除会办由英国人马迪逊担任外，也有聘用数名外国人掌管测量与技术事务，而火车驾驶也有不少是英国人，但到了光绪十八年（1892年）时除了马迪逊留下继续担任会办，协助监督铁路技术外，其他外籍技术人士几乎都返回本国去了。
而商务局厅舍是一位于
台北城外东北角的三板桥庄的洋楼，在这之前原本设于机器局厅舍内。乙未割台后，商务局厅舍曾作为“铁道工夫舍”（铁道养路工宿舍），后来变成骑兵营。