全国博士后管理委员会由
国务院人事、科技、教育、财政等有关部门的负责人和专家组成，负责对全国
博士后工作中的重大问题进行研究和协调。
全国博士后管理委员会主任由人力资源和社会保障部的领导担任。全国博士后管理委员会办公室设在
人力资源和社会保障部专业技术人员管理司，主任由专业技术人员管理司司长担任。全国博士后管理委员会下设若干个学科专家组，每个专家组均由学术水平高、有名望、熟悉国内高等学校和科研机构情况的专家组成，主要任务是对申请设站的单位进行设站评审。
专业技术人员管理司是博士后日常工作的综合管理部门，负责拟定博士后工作的政策法规并组织实施，指导协调全国博士后工作；组织开展博士后工作发展规划和年度计划并组织实施；负责
博士后科研流动站和
博士后科研工作站评审、评议工作；负责
博士后公寓建设的监督管理工作；指导博士后表彰工作；负责博士后工作宣传和网络管理工作；负责博士后研究人员进出站的监督管理工作；制定博士后工作评估办法并组织实施；会同有关部门推进博士后工作国际交流；承担全国博士后管理委员会办公室有关工作。