1996年12月9日，党中央、国务院在北京召开了建国以来的第一次全国卫生工作会议。会后，中共中央、国务院发布《关于卫生改革与发展的决定》，提出今后15年卫生工作的任务及改革发展目标。

2001年2月16日，2001年全国卫生工作会议在北京召开。会议指出，我国卫生改革与发展已进入新阶段，即全方位、整体推进时期。

2002年1月，2002年全国卫生工作会议在北京召开。

2003年2月，2003年全国卫生工作会议召开，卫生部副部长王陇德在会议上作总结讲话。他说，这次全国卫生工作会议既是一次重要的年度工作会议，又是本届部党组主持的最后一次工作年会，是一次承前启后的大会。会议的主要任务是，回顾总结过去5年的卫生工作，以党的十六大精神为指导，确定今后一段时间卫生事业的发展思路和工作重点，研究部署2003年的各项卫生工作。

2004年4月9日，2004年全国卫生工作会议召开。卫生部常务副部长高强在会议上提出，卫生部门将从六个方面开展纠正药品购销和医疗服务中不正之风的专项治理。

2005年1月10日，2005年全国卫生工作会议召开，中共中央政治局委员、国务院副总理吴仪在工作报告上对卫生工作作出批示。会议明确，2005年卫生工作五大重点是：继续加强公共卫生体系建设，全面完成疾病预防控制体系、基本完成医疗救治体系建设；进一步加强重大疾病防治工作，加强重大传染病和慢性非传染病的基础研究，落实重大的传染病和地方病的防治措施；加强农村卫生工作，逐步改善农村卫生条件，稳步扩大新型合作医疗制度试点；稳步开展城市医疗服务体制改革试点；从源头上控制医药价格，坚决纠正医药购销和医疗服务中的不正之风。

2006年1月7日，2006年全国卫生工作会议召开，卫生部部长高强在工作会议上讲话。提出，要控制公立医院特需服务，建立医疗救助基金，不许见死不救，同时要求各地建立平价医院或平价病房。

2007年1月，2007年全国卫生工作会议召开，高强在工作会议上的总结讲话。

2008年1月7日，2008年全国卫生工作会议召开。

2009年1月8日，卫生部在京召开2009年全国卫生工作会议。会议的主要任务是：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入学习实践科学发展观，按照党的十七大、十七届三中全会和中央经济工作会议精神，分析当前卫生工作形势和任务，总结2008年卫生工作，全面部署2009年卫生工作，大力推动深化医药卫生体制改革，努力开创卫生改革发展的新局面。卫生部部长陈竺做了题为《学习实践科学发展观 深化医药卫生体制改革 努力开创卫生改革发展的新局面》的工作报告。

2010年1月，2010年全国卫生工作会议召开。会议主题：深入贯彻党的十七大、十七届三中、四中全会和中央经济工作会议精神，以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入学习实践科学发展观，总结2009年卫生工作，以深化医药卫生体制改革为中心，进一步提高认识，统一思想，振奋精神，全面动员部署2010年重点卫生工作，确保人民群众共享卫生改革发展成果。

以深化医药卫生体制改革和调整完善生育政策为重点，推进公立医院综合改革取得新突破，推进医疗服务质量得到新提升，推进“单独两孩”政策稳妥实施，继续加强公共卫生服务，更加注重改革的系统性、整体性和协同性，更加注重通过体制机制创新释放改革红利，更加注重科学精准的治理能力建设，进一步提高人民健康水平，促进人口长期均衡发展，努力建设人民满意的卫生计生事业。