由于2009年以前的全日制专业硕士太少，
学术型硕士培养模式太理论化而实践太少，不适应社会的发展和需求，教育部觉得应该增加全日制专业硕士学位，作出了硕士研究生主要面向应用的决定，推出了“全日制专业型硕士”作为一种全新的研究生形势，并且从2010年开始减少学术型硕士，减少的名额用以增加全日制专业型硕士。专业型硕士重点培养工程研究能力，成为应用型高级人才，而学术型硕士一般是为“读博”而准备。
比较简单的区分办法是：招收在职人员、以业余时间学习为主的专业学位考试通常在每年的10月份进行，名为“在职人员攻读硕士学位全国联考”，简称“联考“，修业后学历依然是“本科”。但是，有
专业硕士学位招收全日制学生的
专业学位硕士在每年年初举行的“全国硕士研究生统一入学考试”(简称“统考”)中举行，毕业后学历是“研究生”，两者不能混为一谈，全日制专业硕士是学历教育，而以往的GCT在职硕士不是学历教育。
专业学位课程设置以实际应用为导向，以职业需求为目标，以综合素养和应用知识与能力的提高为核心。教学内容强调理论性与应用性课程的有机结合，突出案例分析和实践研究；教学过程重视运用团队学习、案例分析、现场研究、模拟训练等方法；注重培养学生研究实践问题的意识和能力。在具体的学习过程中，要求有为期至少半年（应届本科毕业生实践教学时间原则上不少于1年）的实践环节。而学术学位研究生的课程设置侧重于加强基础理论的学习，重点培养学生从事科学研究创新工作的能力和素质。
由于目前专业型硕士往往招不满，所以很多学校的专业型硕士基本是从
学术型硕士调剂过去的。很多学校的学术型和专业型划的是双线，专业型要比学术型低几十分。有了专业型硕士，很多报普硕而未上的同学仍有机会就读研究生，而不必再战。目前也有很多专业倾向于专业型硕士，比如医学研究生中，专业型硕士比学术型硕士考分高20、30分也是存在的。
专业硕士研究生目前发展的最大制约因素是国家对专业硕士的设想、安排与学生、学校的接收和理解之间的差异，即目前社会上对专业硕士的理解和接受还不够。而目前全日制专业硕士刚刚起步，第一批招收的学生才刚刚毕业，无法从职场上证明其优势，所以社会上很多都持观望态度。
专业学位（professional degree），是相对于
学术性学位（academic degree）而言的学位类型，其目的是培养具有扎实理论基础，并适应特定行业或职业实际工作需要的应用型高层次专门人才。专业学位与学术性学位处于同一层次，培养规格各有侧重，在培养目标上有明显差异。学术性学位按学科设立，其以学术研究为导向，偏重理论和研究，培养大学教师和科研机构的研究人员；而专业学位以专业实践为导向，重视实践和应用，培养在专业和专门技术上受到正规的、高水平训练的高层次人才，授予学位的标准要反映该专业领域的特点和对高层次人才在专门技术工作能力和学术能力上的要求。专业学位教育的突出特点是学术性与职业性紧密结合，获得专业学位的人，主要不是从事学术研究，而是从事具有明显的职业背景的工作，如工程师、医师、教师、律师、会计师等。专业学位与学术性学位在培养目标上各自有明确的定位，因此，在教学方法、教学内容、授予学位的标准和要求等方面均有所不同。
毛东辉主任认为，选择专业硕士应该成为一种相对主流的趋势。他认为，大多数人读研，根本上讲来是为了提升自身的职业竞争力，因此应该以技能为导向，以实践为主。而专业硕士可以更好地满足这样的需求。据介绍，
清华大学经济管理学院目前也正在以此为指导，进行战略调整，普通硕士的招生规模将会被逐步压缩，而MBA等专业硕士的招生规模则会在一定程度上稳定增长，“专业硕士的发展空间仍然十分广阔”。
毛主任也谈到，当前我国的教育基础，还不足以支撑起更大规模的专业硕士教育。在师资力量上，很多教授依然是研究型的，与专业硕士的教学要求还有一定的差距。专业硕士前景广阔，但道路还很长。