内田贤治从小就喜欢看电影，高中时代的他痴迷于《罗马假日》这类好莱坞影片，由此立下了成为一名电影导演的志向。高中毕业后，内田贤治报考日本艺术大学落榜。1992年，内田贤治前往美国，进入旧金山州立大学艺术学部电影学科，专攻电影制作技术与剧本撰作，期间写过几个剧本。1998年，内田贤治毕业后归国、。
2001年，内田贤治邀集了中学校足球队的朋友们，用一台摄像机，花费半年时间拍摄了个人第一部电影作品《
周末布鲁斯》，影片描绘了一个普通上班族奇特的失忆经历，获得了第24届匹亚电影节（日本为选拔新人而设的电影活动，简称PFF）策划奖和才华奖。
2005年，推出了第一部长篇电影《
遇人不熟》，该片由
中村靖日、
山中聪、
板谷由夏等主演，获得了
第58届戛纳国际电影节法国作家及作曲家工会奖年轻评论家奖最佳长片以及大金轨奖，内田贤治获得了法国作家及作曲家工会奖最佳剧本奖。
2008年，执导了由
大泉洋、
佐佐木藏之介、
堺雅人领衔主演的悬疑喜剧片《
放课后》，内田贤治凭借该片获得了第32届日本电影学院奖最佳编剧奖。
2012年，编导了由
堺雅人、
香川照之、
广末凉子等联袂主演的剧情片《
盗钥匙的方法》，影片获得了
第15届上海国际电影节金爵奖最佳影片提名，内田贤治凭借该片获得了第15届上海国际电影节、第34届横滨电影节、第86届
日本电影旬报奖、
第36届日本电影学院奖最佳编剧奖，以及第55届日本电影蓝丝带奖最佳导演奖。
2014年12月26日，内田贤治编剧的电视动画特别篇《
名侦探柯南：江户川柯南失踪事件~史上最糟糕的两天~》首播，这是其首次为动画执笔。
内田贤治在执导《遇人不熟》时就已经进行了叙事技巧上令人惊艳的探索，喜剧电影《放课后》则可以视作内田贤治编剧技巧的成熟。（《电影文学》评）观其执导的《盗钥匙的方法》，《遇人不熟》、《放课后》中显现出的布局功夫经过几年磨练后明显又有精进，而最后半小时峰回路转变成日本版的《杀手欧阳盆栽》则更是让人击节。（《电影世界》评）
利用不经意间发生的突发事件布局、设伏，洒下一条条草蛇灰线，最终再如羚羊挂角般将其串联成整曲乐章，这是内田贤治的看家本事。他执导的电影《放学后》，情节复杂有趣，叙事分两线或三线进行，简洁而紧凑，没有多余的对白及镜头，人物关系微妙。（《外滩画报》评）在《盗钥匙的方法》中，有失意小人物、有腔调十足的杀手，喜感之余还带有励志成分。而身份悬念、喜剧因素还有盲打误撞等风格特征都得到了保留，并得到进一步发挥。（新浪娱乐评）