1960年长野县松本镇的某个早晨，中学生亮介（
妻夫木聪 饰）在上学途中，捡到了一苹黑色的流浪狗，当天正好是校庆，班上的同学正准备参加「蜻蜓祭」化妆游行，因为这苹流浪狗意外地跟著亮介一起出现，反而成了游行中的焦点，也多亏有了它的参与，全校都给了他们热烈的掌声，因此这苹狗就被取名为小黑。小黑很快就成了秋津中学的一份子，在学校里是人见人爱，它可以自由地四处走动，甚至和学生们一起上课、和老师们一起开会。
到了晚上，小黑就陪著学校里的工友（井川比佐治饰演）一起巡视校园，然後就睡在管理员的宿舍里。亮介和他的死党孝二（
新井浩文 饰），同时喜欢上班上同学雪子（
伊藤步 饰）。处于微妙三角恋情中的三个人，甚至经常相约一起去看电影，直到一天发生了车祸，彻底改变了他们的一生。十年後，小黑还是住在秋津中学里，成了校史上最特别的一匹狗。小黑的名字甚至被列入学校的教职员名册里，媒体也争相报导这所学校和小黑的故事，可是小黑完全不以为意，年复一年地和学生们一起，过著单纯的生活。
此时，已经当上正式执业兽医的亮介，又回到镇上参加老朋友的婚礼。亮介在当年的不告而别之後，再次和雪子重逢，亮介去学校里探望小黑，发现小黑已经是年老体衰了。小黑真的病得很严重，一定要动手术才行。