农业部微生物肥料和食用菌菌种质量监督检验测试中心成立于1995年12月，是农业部授权的通过国家计量认证的专业性微生物肥料和食用菌菌种质检机构。
主要承担全国微生物肥料(微生物菌剂)和食用菌菌种及产品的质量监督检验，向社会提供产品质量检验公证数据；受农业部委托，承担全国微生物肥料产品的登记受理和食用菌菌种的认定工作；从事相关标准、质检新技术和微生物作用机理等基础与应用基础研究。
中心设有理化检测室、微生物检测室、菌种鉴定和分子生物学检测室。拥有先进的实验分析仪器设备50多台（套），能满足中心开展质检及相关研究工作需要。获省部级科技进步奖3项，主持制定国家标准3部、农业行业标准19部，专利5项。
研究方向：
质检新技术新方法研究
标准研究制定与行业发展研究
根瘤菌共生固氮应用基础研究
农业废弃物的微生物转化利用
微生物作用机理与微生物生态学研究