农业部淡水水产生物技术与遗传育种重点实验室是农业部下设科研机构。

农业部淡水水产生物技术与遗传育种重点实验室是于1990年农业部批准成立的首批部级重点开放实验室之一，依托在中国水产科学研究院黑龙江水产研究所。实验下设：鱼类遗传学与常规育种、分子生物学与基因工程育种、基因组学与分子育种、细胞生物学与细胞工程育种、种质资源及新养殖对象开发利用5个分研究室， 实验室以开发、培育适应北方特殊生境下的优良品种为基本任务，以建立新的育种技术和培育鱼类新品种为核心工作。以应用基础研究为主即开发新的育种技术和培育适应北方养殖环境下的大宗产品的优良品种，同时向基础方向发展，开展一些对行业长远发展有重大影响的基础研究如基因组资源的开发、北方鱼类一些特殊遗传和生理性状的分子机制等，高新技术如基因工程育种的方法研究等，同时也开展一些促进行业发展的关键性技术研究如土著鱼类的开发利用、性别控制技术等。实验室具有良好的实验条件，已成为我国水产生物工程育种的重要科学研究基地之一。今后实验室将在鱼类生物工程育种及相关研究领域继续进行实实在在的创新性工作，将实验室建设成为具有鲜明特色的、有国际知名度的养殖鱼类育种实验室。

(1)从分子水平、细胞水平、个体水平和群体水平等不同层次研究探讨北方主要养殖鱼类和黑龙江流域特有野生鱼类的遗传特性并以此为出发点运用育种新技术进行鱼类养殖新品种的选育和遗传改良。

(2)基础遗传学与常规育种。

(3)冷水性鱼类及冷水水域重要经济鱼类的种质资源与新养殖对象的开发利用。

(4)养殖鱼类的基因组资源与遗传工具的开发。

(1)开发我国主要水产养殖种类的基因组资源和实际应用技术。

(2)剖析、阐述我国主养鱼类和北方特有鱼类经济性状的遗传基础。

(3)开创新的鱼类育种理论、建立有效实用的育种技术。

(4)持续不断地向产业提供培育出的优良鱼类新品种。